148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1455 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1455  amine oxidase  100 
 
 		 439 aa  856    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  67.05 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  67.23 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  56.84 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  55.3 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1548  amine oxidase  54.46 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  53.86 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  59.82 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  52.49 
 
 		 426 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  49.64 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  47.91 
 
 		 448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  39.17 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  41.19 
 
 		 441 aa  209  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  38.65 
 
 		 424 aa  176  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  35.99 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  33.85 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.18 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  28.18 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  29.56 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.39 
 
 		 424 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  28.79 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.29 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  27.96 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  26.72 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  27.64 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.7 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.25 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  27.51 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.57 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  25.09 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  20.3 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  28.57 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  28.03 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  28.03 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  28.03 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.48 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.69 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.96 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  25.21 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.52 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  26.84 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.03 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  25.11 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  26.98 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.8 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.56 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.86 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  29.69 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  28.4 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  21.46 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  25.11 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.87 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  29.17 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  26.48 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  26.48 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  29.48 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  26.3 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  29.48 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.04 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.33 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  21.37 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.46 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  35.9 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  30.36 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  29.46 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.3 
 
 		 417 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  29.17 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  33.33 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.9 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  26.17 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  35.9 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  29.46 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  37.18 
 
 		 479 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  28.57 
 
 		 499 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.71 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.45 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  43.08 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  30.23 
 
 		 479 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.86 
 
 		 647 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  27.68 
 
 		 591 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  34.62 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  26.36 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  26.91 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  31.86 
 
 		 488 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.71 
 
 		 459 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  30.36 
 
 		 488 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  29.17 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  28.49 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.63 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.21 
 
 		 422 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 482 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  41.18 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  39.24 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>