136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5505 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  92.33 
 
 		 417 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  93.53 
 
 		 417 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  98.32 
 
 		 417 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  93.53 
 
 		 417 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  84.65 
 
 		 417 aa  706    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  94 
 
 		 417 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  100 
 
 		 417 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  57.79 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  55.95 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  57.07 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  45.3 
 
 		 418 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  48.35 
 
 		 438 aa  346  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  48.33 
 
 		 424 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  45.54 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  45.78 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  44.74 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  44.5 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.67 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.15 
 
 		 415 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  42.51 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.08 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.08 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.08 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.82 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.58 
 
 		 419 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  38.8 
 
 		 419 aa  279  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  41.65 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  41.65 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  38.76 
 
 		 437 aa  236  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  29.6 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  23.53 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.76 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  25.27 
 
 		 455 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.97 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.44 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.7 
 
 		 453 aa  96.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  23.53 
 
 		 453 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  27.39 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  29.58 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.76 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.11 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  21.13 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.01 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.16 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  31.44 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.54 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.54 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.54 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  20.76 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.83 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.47 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  20.08 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  36.07 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  20.5 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  20.68 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  20.47 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  20.47 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  19.7 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  31.45 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  19.87 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  19.7 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.98 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  26.38 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.44 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  29.71 
 
 		 562 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  20.59 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  20.56 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  22.25 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  27.05 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  27.71 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  22.22 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  23.82 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  22.15 
 
 		 482 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  20.47 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  50.88 
 
 		 477 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  20.3 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  32.78 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  28.44 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  29.63 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.57 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.44 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  20.26 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  44.83 
 
 		 481 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  38.16 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.64 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  22.2 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  28.24 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  38.16 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  37.66 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  40 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  35.71 
 
 		 552 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  27.04 
 
 		 519 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  27.96 
 
 		 425 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  22.73 
 
 		 460 aa  50.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  38.16 
 
 		 488 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  25 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  27.88 
 
 		 475 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  43.1 
 
 		 516 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.72 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>