270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01331 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  98.14 
 
 
484 aa  986    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  70.32 
 
 
478 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  72.07 
 
 
486 aa  743    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  69.73 
 
 
488 aa  737    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  68.1 
 
 
488 aa  726    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  95.25 
 
 
499 aa  959    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  65.69 
 
 
481 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  100 
 
 
484 aa  1000    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  91.12 
 
 
484 aa  923    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  72.07 
 
 
486 aa  742    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  68.23 
 
 
490 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  60.83 
 
 
490 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  60.83 
 
 
490 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  59.37 
 
 
479 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  59.63 
 
 
489 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  59.37 
 
 
482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  60.42 
 
 
479 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  59.7 
 
 
483 aa  592  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  52.06 
 
 
591 aa  518  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  35.91 
 
 
455 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  36.1 
 
 
453 aa  296  4e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  36.61 
 
 
453 aa  296  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  35.44 
 
 
453 aa  292  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  35.88 
 
 
453 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  35.2 
 
 
453 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  34.38 
 
 
453 aa  286  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  35.82 
 
 
479 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  35.7 
 
 
475 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  35.29 
 
 
472 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  35.76 
 
 
475 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  34.9 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  35 
 
 
471 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.89 
 
 
472 aa  273  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  33.61 
 
 
466 aa  269  7e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  33.6 
 
 
473 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.47 
 
 
474 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  33.4 
 
 
466 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  33.4 
 
 
465 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  32.56 
 
 
463 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  34.45 
 
 
479 aa  264  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  34.93 
 
 
477 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  34.17 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  34.17 
 
 
462 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.4 
 
 
459 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  33.47 
 
 
589 aa  260  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  32.92 
 
 
472 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  33.47 
 
 
460 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  32.48 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  32.9 
 
 
459 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  31.43 
 
 
599 aa  232  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  31.55 
 
 
462 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  30.48 
 
 
624 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  32.03 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  30.3 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  29.94 
 
 
460 aa  209  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  30.06 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  23.28 
 
 
503 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  21.56 
 
 
451 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.85 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  23.38 
 
 
500 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  23.59 
 
 
520 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  24.53 
 
 
481 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.04 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  23.85 
 
 
562 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  21.17 
 
 
452 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  21.17 
 
 
452 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  21.17 
 
 
452 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.78 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  21.22 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  21.64 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  21.69 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  21.69 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  19.79 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  28.69 
 
 
647 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  20.92 
 
 
811 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  28.29 
 
 
647 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.18 
 
 
639 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  30.83 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  21.62 
 
 
569 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  24.65 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  24.65 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  19.87 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  20.93 
 
 
417 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  24.17 
 
 
989 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  20.3 
 
 
417 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  20.45 
 
 
441 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  21.35 
 
 
417 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  20.3 
 
 
417 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  21.35 
 
 
417 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  24.41 
 
 
523 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  21.81 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  23.77 
 
 
482 aa  62  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.11 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.62 
 
 
640 aa  61.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  19.48 
 
 
486 aa  60.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  20.94 
 
 
506 aa  60.1  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  27.21 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  27.2 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  45.45 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.36 
 
 
447 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>