244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0949 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  83 
 
 		 453 aa  804    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 453 aa  939    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  84.29 
 
 		 453 aa  819    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  83.19 
 
 		 453 aa  801    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  80.84 
 
 		 455 aa  786    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  83.85 
 
 		 453 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  88.52 
 
 		 453 aa  855    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  41.39 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  41.39 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  39.2 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  39.87 
 
 		 479 aa  340  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  40.48 
 
 		 474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  39.57 
 
 		 472 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  39.57 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  39.35 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  38.48 
 
 		 472 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  40.17 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  39 
 
 		 479 aa  329  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  39.87 
 
 		 471 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  38.84 
 
 		 473 aa  329  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  39.78 
 
 		 472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  38.71 
 
 		 465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  38.66 
 
 		 459 aa  326  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  38.6 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  38.28 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  38.06 
 
 		 466 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  36.24 
 
 		 589 aa  321  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  37.31 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  36.25 
 
 		 599 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  36 
 
 		 483 aa  302  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  35.12 
 
 		 490 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  35.05 
 
 		 489 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  35.12 
 
 		 490 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  35.07 
 
 		 624 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  35.86 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  37.21 
 
 		 459 aa  293  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  35.44 
 
 		 484 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  36.42 
 
 		 484 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  34.45 
 
 		 479 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  35.44 
 
 		 499 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  36.24 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  33.47 
 
 		 479 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  36.16 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  35.27 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  33.95 
 
 		 482 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  35.62 
 
 		 481 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  34.1 
 
 		 488 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  33.81 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  33.89 
 
 		 488 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  34.55 
 
 		 461 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  33.81 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  34.91 
 
 		 552 aa  276  7e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  34.47 
 
 		 462 aa  275  9e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  35.27 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  34.85 
 
 		 490 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  33.13 
 
 		 591 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.71 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25.33 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.02 
 
 		 477 aa  116  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.65 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  22.22 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.69 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  24.69 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  24.69 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  24.69 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.16 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  23.01 
 
 		 503 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.97 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  24.18 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  23.75 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.75 
 
 		 417 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  23.75 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  23.75 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.95 
 
 		 417 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  23.71 
 
 		 520 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  26.38 
 
 		 647 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.38 
 
 		 647 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  23.73 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  21.11 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  23.52 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  23.52 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  25.82 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.36 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  22.27 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  24.25 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.59 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  21.29 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.52 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.8 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  23.8 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  23.33 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  20.22 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  26.96 
 
 		 562 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  23.19 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  23.99 
 
 		 811 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.7 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  20.43 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  22.8 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  22.41 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.22 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>