136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3204 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  100 
 
 		 477 aa  974    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  33.62 
 
 		 481 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.61 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.99 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  29.1 
 
 		 562 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  28.38 
 
 		 452 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  28.38 
 
 		 452 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  28.38 
 
 		 452 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.9 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  25.86 
 
 		 472 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  24.73 
 
 		 466 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  29.52 
 
 		 569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  29.53 
 
 		 486 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  25.32 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  25.32 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  23.83 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  27.04 
 
 		 589 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.72 
 
 		 453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.03 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  25.59 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.37 
 
 		 459 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  24.57 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  27.97 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.79 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.5 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.2 
 
 		 474 aa  134  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.98 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  23.08 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.63 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.22 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  26.16 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  27.42 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  23.88 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.8 
 
 		 475 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  26.29 
 
 		 599 aa  130  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  25 
 
 		 479 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.56 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  25.43 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.8 
 
 		 475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.51 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.84 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  26.47 
 
 		 552 aa  127  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  24.94 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.6 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25.85 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  24.64 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.9 
 
 		 624 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  24.8 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  26.61 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.02 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.4 
 
 		 490 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.4 
 
 		 490 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  25.98 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.35 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  24.69 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  23.13 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  26.8 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.55 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  23.6 
 
 		 486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  24.02 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.23 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  24.66 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  23.27 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  24.49 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  23.28 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  24.49 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  22.54 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  22.7 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  24.02 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  23.08 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.58 
 
 		 447 aa  101  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  22.61 
 
 		 591 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.73 
 
 		 811 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  24.78 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  24.57 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  24.14 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  24.72 
 
 		 416 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  25.3 
 
 		 490 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.55 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.11 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  25.05 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.96 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  25.55 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.62 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.62 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.56 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  24.31 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  27.27 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  24.95 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.05 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.05 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.5 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.22 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.29 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  23.68 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  24.59 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  31.61 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.07 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  33.11 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>