220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5080 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  100 
 
 		 506 aa  1002    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  100 
 
 		 506 aa  1002    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  98.22 
 
 		 506 aa  984    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  69.25 
 
 		 511 aa  628  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  71.27 
 
 		 481 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  64.36 
 
 		 482 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  59.2 
 
 		 523 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  57.61 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  54.89 
 
 		 551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  54.49 
 
 		 546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  51.19 
 
 		 519 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  46.83 
 
 		 811 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  40.82 
 
 		 508 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  42.27 
 
 		 508 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.56 
 
 		 643 aa  148  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.56 
 
 		 640 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.56 
 
 		 639 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.63 
 
 		 642 aa  144  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  39.44 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.78 
 
 		 644 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  31.64 
 
 		 647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  31.64 
 
 		 647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  33.73 
 
 		 645 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  30.7 
 
 		 647 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  30.05 
 
 		 648 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  23.61 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.88 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  23.23 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.12 
 
 		 490 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.12 
 
 		 490 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  23.92 
 
 		 479 aa  97.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  26.68 
 
 		 520 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  23.14 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  22.65 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  23.77 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  23.3 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  23.98 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.65 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  24.95 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.54 
 
 		 453 aa  90.9  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  23.88 
 
 		 455 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  25.83 
 
 		 624 aa  89  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  23.21 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.29 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  24.95 
 
 		 599 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  23.41 
 
 		 591 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.31 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  22.09 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  23.03 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  21.63 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  25.75 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.55 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  22.09 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25.1 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  28.38 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  22.4 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.25 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  24.3 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  24.55 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  24.82 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  25.57 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  27.9 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  27.24 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.98 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.1 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.54 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  22.55 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.49 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.47 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.47 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.47 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  24.75 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.84 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  23.64 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.54 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.67 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.84 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  24.54 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.71 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  24.79 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  27.43 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.72 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  21.33 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  22.86 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.94 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  24.9 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  25.18 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  25.18 
 
 		 594 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  25.18 
 
 		 594 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  24.7 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  21.07 
 
 		 462 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.96 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  23.69 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  29.19 
 
 		 592 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  21.51 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  49.21 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  39 
 
 		 536 aa  54.7  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  27.52 
 
 		 562 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  23.44 
 
 		 544 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.45 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>