176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3736 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  73.85 
 
 
503 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  70.06 
 
 
500 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  100 
 
 
520 aa  1066    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  43.46 
 
 
506 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  37.62 
 
 
544 aa  292  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  37.1 
 
 
543 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  36.75 
 
 
543 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  35.59 
 
 
578 aa  286  8e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10438  PDS-like 1, phytoene desaturase-like protein, phytoene dehydrogenase-like protein  35.02 
 
 
545 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54051  pds-like2, phytoene desaturase-like protein  33.78 
 
 
605 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.250882  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43187  predicted protein  33.05 
 
 
557 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  27.56 
 
 
463 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  25.85 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  24.9 
 
 
483 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  26.03 
 
 
482 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  25 
 
 
453 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  26.9 
 
 
479 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  25.74 
 
 
453 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  23.12 
 
 
486 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  27.16 
 
 
464 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.68 
 
 
477 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.4 
 
 
624 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  27.39 
 
 
462 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  24.69 
 
 
599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  22.5 
 
 
486 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  24.1 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  24.01 
 
 
484 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  24.74 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.23 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  23.8 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  24.61 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.23 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.85 
 
 
479 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  24.12 
 
 
479 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  24.06 
 
 
484 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  24.1 
 
 
488 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  23.43 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  23.08 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.48 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  25.32 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.48 
 
 
475 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.87 
 
 
474 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  23.46 
 
 
489 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  24.57 
 
 
472 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  24.62 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  24.04 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  26.53 
 
 
461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24 
 
 
471 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.45 
 
 
459 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  25 
 
 
472 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  25.21 
 
 
453 aa  110  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  26.27 
 
 
472 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.42 
 
 
473 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  25.2 
 
 
589 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  23.58 
 
 
466 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.27 
 
 
472 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.68 
 
 
465 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  23.24 
 
 
466 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.92 
 
 
453 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  24.39 
 
 
460 aa  99.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  26.57 
 
 
459 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  23.66 
 
 
490 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  26.68 
 
 
506 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  26.68 
 
 
506 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  26.37 
 
 
506 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  27.38 
 
 
523 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  24.3 
 
 
591 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  27.64 
 
 
520 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  26.42 
 
 
811 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  26.59 
 
 
647 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  25.12 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  24.19 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  26.07 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  28 
 
 
647 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  28 
 
 
647 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  25.75 
 
 
460 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  23.83 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  24.89 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.36 
 
 
643 aa  73.6  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  27.07 
 
 
645 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  24.3 
 
 
438 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  23.42 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
639 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.49 
 
 
439 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  28.38 
 
 
639 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  24.32 
 
 
551 aa  70.1  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  24.02 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  26.47 
 
 
648 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  24.69 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.85 
 
 
640 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  25.73 
 
 
546 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.24 
 
 
642 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  25.88 
 
 
481 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.88 
 
 
644 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.96 
 
 
437 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  29.48 
 
 
440 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.37 
 
 
444 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  31.38 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.28 
 
 
432 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  22.94 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>