42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54051 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_54051  pds-like2, phytoene desaturase-like protein  100 
 
 		 605 aa  1232    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.250882  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43187  predicted protein  98.92 
 
 		 557 aa  1053    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  32.96 
 
 		 500 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  33.39 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  34.4 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  31.3 
 
 		 506 aa  216  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  31.26 
 
 		 578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10438  PDS-like 1, phytoene desaturase-like protein, phytoene dehydrogenase-like protein  29.64 
 
 		 545 aa  173  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  31.73 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  29.18 
 
 		 543 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  28.68 
 
 		 543 aa  154  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.74 
 
 		 639 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.91 
 
 		 643 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.65 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  29.51 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.27 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  23.68 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  23.68 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.71 
 
 		 811 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  24.4 
 
 		 489 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  22.28 
 
 		 499 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  25 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  23.43 
 
 		 477 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.32 
 
 		 642 aa  54.3  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  23.85 
 
 		 484 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  22.86 
 
 		 484 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  21.78 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  23.84 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  34.74 
 
 		 488 aa  51.2  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  26.95 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  23.85 
 
 		 479 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  22.85 
 
 		 589 aa  47.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  30.53 
 
 		 478 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 570 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  25.77 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  21.64 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  24.92 
 
 		 591 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  22.05 
 
 		 473 aa  44.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  22.44 
 
 		 577 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  23.06 
 
 		 508 aa  44.3  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  31.4 
 
 		 647 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  36.56 
 
 		 506 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>