More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1698 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  71.61 
 
 		 639 aa  932    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.34 
 
 		 642 aa  795    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  59.5 
 
 		 639 aa  787    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.14 
 
 		 643 aa  797    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.67 
 
 		 644 aa  757    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 		 640 aa  1320    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  32.57 
 
 		 647 aa  348  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  32.77 
 
 		 647 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  33.13 
 
 		 647 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  32.36 
 
 		 645 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  32.72 
 
 		 648 aa  326  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  37.66 
 
 		 811 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  35.91 
 
 		 481 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  37.56 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  37.56 
 
 		 506 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  37.56 
 
 		 506 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  36.53 
 
 		 511 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  36.97 
 
 		 519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  35.48 
 
 		 523 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  36.74 
 
 		 551 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  36.92 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  34.74 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  34.57 
 
 		 508 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  34.11 
 
 		 546 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  35.9 
 
 		 508 aa  110  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  26.22 
 
 		 506 aa  87  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 		 148 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  27.41 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  24.44 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  28.78 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  28.22 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  26.94 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  26.64 
 
 		 490 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  26.64 
 
 		 490 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.98 
 
 		 139 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  26.92 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  26.77 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  26.44 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  26.41 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  27.78 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  27.6 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.31 
 
 		 220 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25.95 
 
 		 451 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 		 139 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 		 130 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  40.26 
 
 		 139 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 		 135 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  25.55 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  25.36 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  27.88 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  26.64 
 
 		 520 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 		 130 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  27.44 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  24.82 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  34.21 
 
 		 139 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  26.59 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.21 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.23 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  26.19 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  34.88 
 
 		 181 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  26.59 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  43.59 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  26.12 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  23.81 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  26.62 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.58 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  40.32 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  25.4 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  25.58 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  24.65 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.08 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  43.24 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  23.26 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  31.31 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  25.76 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  25.47 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.38 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  26.62 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  38.71 
 
 		 182 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  29.31 
 
 		 178 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  31.63 
 
 		 181 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  24.71 
 
 		 488 aa  57  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  41.27 
 
 		 131 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  36 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  38.33 
 
 		 63 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  42.03 
 
 		 131 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  36.25 
 
 		 436 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  32.14 
 
 		 396 aa  56.2  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.24 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  25.86 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  25.87 
 
 		 543 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.18 
 
 		 179 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.55 
 
 		 138 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  32.98 
 
 		 481 aa  55.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.32 
 
 		 159 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.31 
 
 		 182 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 435 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.03 
 
 		 142 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 		 128 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>