193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5205 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  100 
 
 
565 aa  1123    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  44.23 
 
 
989 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
609 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  39.54 
 
 
594 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  39.54 
 
 
594 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  39.54 
 
 
594 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2309  hypothetical protein  30.23 
 
 
972 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2356  hypothetical protein  30.23 
 
 
972 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2348  hypothetical protein  30.23 
 
 
972 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13759  oxidoreductase  29.86 
 
 
602 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649685  normal  0.108342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  25.04 
 
 
577 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
578 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.33 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.72 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  24.66 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1394  hypothetical protein  21.77 
 
 
530 aa  75.1  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.97 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.97 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  22.82 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  25.65 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  25.65 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.81 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.39 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  22.54 
 
 
473 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.2 
 
 
465 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.39 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.82 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  26.31 
 
 
482 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  24.95 
 
 
479 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  24.62 
 
 
483 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  24.26 
 
 
489 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.57 
 
 
643 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  22.16 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.67 
 
 
453 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  25.08 
 
 
453 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  44.62 
 
 
647 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  44.62 
 
 
647 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  65.22 
 
 
469 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  23.57 
 
 
453 aa  57  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  43.75 
 
 
647 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  26.79 
 
 
591 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.51 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  25.15 
 
 
479 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  23.75 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  23.55 
 
 
503 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.18 
 
 
639 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.62 
 
 
479 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  23.41 
 
 
455 aa  54.7  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  22.28 
 
 
624 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  24.46 
 
 
639 aa  54.3  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  24.4 
 
 
488 aa  53.9  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.02 
 
 
475 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.95 
 
 
640 aa  53.9  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  41.27 
 
 
645 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  23.3 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  23 
 
 
484 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  23.32 
 
 
484 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  63.89 
 
 
769 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  43.64 
 
 
436 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  23.21 
 
 
488 aa  50.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.62 
 
 
459 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  24.04 
 
 
453 aa  50.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  37.36 
 
 
495 aa  50.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  41.38 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  27.93 
 
 
565 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  45.33 
 
 
431 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  23.37 
 
 
453 aa  50.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  23.1 
 
 
499 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  41.33 
 
 
523 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  26.27 
 
 
484 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  46.43 
 
 
496 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  23.81 
 
 
589 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  49.06 
 
 
450 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.41 
 
 
644 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  49.06 
 
 
450 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  23.46 
 
 
478 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  51.11 
 
 
644 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  35.71 
 
 
429 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.15 
 
 
552 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.16 
 
 
995 aa  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.573197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  44.26 
 
 
572 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  40.68 
 
 
445 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  56.52 
 
 
428 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  24.84 
 
 
460 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  47.37 
 
 
381 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  58.33 
 
 
796 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  21.55 
 
 
599 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2861  flavin-containing monooxygenase FMO  63.89 
 
 
489 aa  47  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000341045  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  51.22 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  48.78 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  21.5 
 
 
570 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  22.37 
 
 
486 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.62 
 
 
642 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.93 
 
 
461 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  51.22 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
1013 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  40 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  38.36 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  45.9 
 
 
508 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>