More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3439 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  44.64 
 
 
771 aa  724    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.56 
 
 
771 aa  835    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  51.56 
 
 
769 aa  814    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.75 
 
 
776 aa  805    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  48.39 
 
 
788 aa  786    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
796 aa  1649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  42.09 
 
 
768 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.44 
 
 
784 aa  586  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.75 
 
 
758 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.31 
 
 
902 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  38.62 
 
 
836 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.64 
 
 
797 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  35.22 
 
 
763 aa  547  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.68 
 
 
802 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  28.46 
 
 
370 aa  173  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  27.94 
 
 
370 aa  170  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  29.44 
 
 
423 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  28.99 
 
 
392 aa  157  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  31.2 
 
 
256 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.99 
 
 
461 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  31.44 
 
 
461 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.67 
 
 
623 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  31.09 
 
 
461 aa  137  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  28.49 
 
 
665 aa  137  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.14 
 
 
411 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.49 
 
 
412 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  25.7 
 
 
366 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.22 
 
 
1481 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  27.13 
 
 
347 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  37.5 
 
 
469 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.04 
 
 
1487 aa  120  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.86 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.37 
 
 
577 aa  115  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.67 
 
 
476 aa  115  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  39.01 
 
 
599 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.31 
 
 
477 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.9 
 
 
579 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.64 
 
 
464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  37.62 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.64 
 
 
464 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5479  Glutamate synthase (NADPH)  39.36 
 
 
599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1136  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
598 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.83 
 
 
461 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.83 
 
 
658 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.6 
 
 
448 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.8 
 
 
1126 aa  111  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.32 
 
 
578 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.54 
 
 
464 aa  110  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.94 
 
 
479 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.16 
 
 
1406 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.43 
 
 
996 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.83 
 
 
1410 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.84 
 
 
609 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  36.95 
 
 
471 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 
1440 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2073  glutamate synthase, beta subunit, putative  31.98 
 
 
439 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.63 
 
 
480 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.47 
 
 
1073 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.64 
 
 
468 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  34.02 
 
 
468 aa  109  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.07 
 
 
699 aa  108  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.5 
 
 
579 aa  108  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.02 
 
 
468 aa  108  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  31.88 
 
 
482 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  33.5 
 
 
688 aa  107  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 
598 aa  107  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.44 
 
 
466 aa  107  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  32.32 
 
 
503 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.18 
 
 
474 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.33 
 
 
653 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.07 
 
 
447 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.88 
 
 
1425 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.26 
 
 
596 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.17 
 
 
469 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.33 
 
 
653 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.55 
 
 
578 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.95 
 
 
458 aa  106  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  35.15 
 
 
469 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  30.98 
 
 
1150 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.77 
 
 
447 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  32.66 
 
 
482 aa  105  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
469 aa  105  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  28.78 
 
 
467 aa  104  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  35.71 
 
 
597 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
469 aa  104  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  35.38 
 
 
459 aa  104  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.51 
 
 
895 aa  104  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 
1421 aa  104  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.15 
 
 
659 aa  104  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.34 
 
 
438 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.31 
 
 
1440 aa  103  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  33.85 
 
 
462 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.55 
 
 
446 aa  103  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.16 
 
 
656 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.29 
 
 
608 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  33.33 
 
 
1385 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  32.23 
 
 
492 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.94 
 
 
555 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.07 
 
 
467 aa  103  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>