More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0999 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.56 
 
 
796 aa  835    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  53.21 
 
 
771 aa  859    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 
769 aa  696    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
771 aa  1587    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.41 
 
 
776 aa  703    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  62.71 
 
 
788 aa  1034    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  42 
 
 
768 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.06 
 
 
758 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.93 
 
 
902 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.96 
 
 
784 aa  545  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.21 
 
 
797 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  36.96 
 
 
836 aa  525  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  33.68 
 
 
763 aa  478  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.19 
 
 
802 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  27.14 
 
 
423 aa  158  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  30.22 
 
 
392 aa  157  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  32.51 
 
 
461 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.4 
 
 
461 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  31.4 
 
 
461 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  25 
 
 
370 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  25 
 
 
370 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.84 
 
 
412 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  29.64 
 
 
347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.64 
 
 
411 aa  127  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  35.96 
 
 
469 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  29.64 
 
 
256 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  29 
 
 
623 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  34.09 
 
 
455 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.24 
 
 
469 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.12 
 
 
464 aa  120  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36 
 
 
476 aa  120  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.55 
 
 
466 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.14 
 
 
461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  27.6 
 
 
665 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  36.45 
 
 
482 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  35.64 
 
 
469 aa  118  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  37.44 
 
 
464 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.36 
 
 
477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  34.1 
 
 
470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.39 
 
 
1487 aa  117  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.22 
 
 
555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.49 
 
 
458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.15 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  34.41 
 
 
1150 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.79 
 
 
1406 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2073  glutamate synthase, beta subunit, putative  31.17 
 
 
439 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7262  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.22 
 
 
466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  35.86 
 
 
483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.95 
 
 
480 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  36 
 
 
747 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.8 
 
 
578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.88 
 
 
1410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.16 
 
 
658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  35.05 
 
 
469 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  36.04 
 
 
480 aa  112  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  32.95 
 
 
462 aa  111  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.83 
 
 
571 aa  112  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  38 
 
 
468 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.33 
 
 
578 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.42 
 
 
653 aa  111  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0123  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.11 
 
 
643 aa  111  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0636906  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.96 
 
 
596 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.83 
 
 
467 aa  110  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  34.92 
 
 
616 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  37.5 
 
 
468 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.16 
 
 
699 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.15 
 
 
463 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  34.18 
 
 
477 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
996 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_131  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase protein  38.27 
 
 
677 aa  110  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000174101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.05 
 
 
891 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  33.85 
 
 
468 aa  109  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  35.89 
 
 
473 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.88 
 
 
1440 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  34.07 
 
 
476 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30 
 
 
653 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  35.78 
 
 
470 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  36.27 
 
 
994 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  35.53 
 
 
480 aa  109  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
598 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33 
 
 
577 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.3 
 
 
543 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  32.79 
 
 
612 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  36.04 
 
 
489 aa  108  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
615 aa  108  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.33 
 
 
479 aa  108  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  35.38 
 
 
459 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  31.96 
 
 
688 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.07 
 
 
659 aa  108  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.05 
 
 
1481 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0247  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.65 
 
 
600 aa  107  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.48 
 
 
464 aa  107  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  38.04 
 
 
597 aa  107  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.89 
 
 
895 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  33.68 
 
 
469 aa  107  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  33.5 
 
 
473 aa  107  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.72 
 
 
1385 aa  107  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  34.52 
 
 
463 aa  107  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37 
 
 
608 aa  107  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.11 
 
 
1126 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>