141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1978 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  100 
 
 
347 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  43.75 
 
 
665 aa  269  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  41.26 
 
 
623 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.94 
 
 
411 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.35 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  43.34 
 
 
392 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  38.55 
 
 
366 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.73 
 
 
758 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  26.63 
 
 
370 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  26.5 
 
 
370 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0903  hypothetical protein  31.33 
 
 
367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1873  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.75 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.64 
 
 
771 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.14 
 
 
802 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1874  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.86 
 
 
377 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  27.32 
 
 
771 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  24.57 
 
 
763 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.13 
 
 
796 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
769 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  27.91 
 
 
768 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  29.87 
 
 
836 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.97 
 
 
797 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  28.92 
 
 
256 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.11 
 
 
776 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  24.24 
 
 
788 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  23.24 
 
 
423 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.74 
 
 
784 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.35 
 
 
902 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0641  iron-sulfur binding reductase  24.63 
 
 
330 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3863  hypothetical protein  29.39 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1316  hypothetical protein  26.1 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  25.98 
 
 
549 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.62 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.86 
 
 
699 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  27.18 
 
 
639 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1499  heterodisulfide reductase, subunit D  25.46 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0669416  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  23.66 
 
 
654 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0554  hypothetical protein  23.16 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.46 
 
 
737 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  26.25 
 
 
716 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  24.06 
 
 
617 aa  63.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0969  hypothetical protein  27.96 
 
 
233 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000386053  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  27.04 
 
 
490 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.8 
 
 
481 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  24.27 
 
 
588 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.18 
 
 
717 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  23.17 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  23.95 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.14 
 
 
487 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  22.86 
 
 
643 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.61 
 
 
711 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.83 
 
 
385 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.61 
 
 
711 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  24.62 
 
 
711 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  23.08 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.91 
 
 
694 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  23.86 
 
 
699 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  23.48 
 
 
375 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  22.87 
 
 
372 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  24.24 
 
 
678 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  24.13 
 
 
716 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.62 
 
 
721 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  24.84 
 
 
727 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.99 
 
 
664 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0085  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.93 
 
 
489 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52676  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.88 
 
 
656 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.16 
 
 
662 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.99 
 
 
664 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.74 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  23.94 
 
 
388 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  24.46 
 
 
652 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.74 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.06 
 
 
641 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  21.96 
 
 
432 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  23.83 
 
 
409 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.62 
 
 
662 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  24.05 
 
 
658 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  23.13 
 
 
678 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.88 
 
 
656 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  23.18 
 
 
661 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  22.55 
 
 
1015 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  23.55 
 
 
661 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  26.94 
 
 
683 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.13 
 
 
1046 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  24.13 
 
 
1046 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  24.13 
 
 
1042 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1652  hypothetical protein  23.68 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.59 
 
 
686 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  22.42 
 
 
1044 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.44 
 
 
683 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.43 
 
 
722 aa  49.7  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.81 
 
 
387 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.91 
 
 
1215 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.49 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436212  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.13 
 
 
494 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  21.7 
 
 
661 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.2 
 
 
494 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.58 
 
 
714 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0771  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.27 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0497692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  22.32 
 
 
1027 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>