More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0139 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  100 
 
 
481 aa  982    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  62.26 
 
 
487 aa  632  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.67 
 
 
490 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0085  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.04 
 
 
489 aa  568  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52676  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.35 
 
 
481 aa  554  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  43.12 
 
 
494 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  42.08 
 
 
494 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  43.04 
 
 
494 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  41.86 
 
 
494 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0717  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  39.4 
 
 
538 aa  336  5e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.942612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  33.24 
 
 
409 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  32.97 
 
 
356 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  33.63 
 
 
388 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  28.77 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.1 
 
 
434 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  30 
 
 
412 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.45 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  30.03 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.75 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  30.31 
 
 
375 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  29.38 
 
 
423 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.95 
 
 
414 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.31 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.32 
 
 
426 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  29.92 
 
 
421 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  29.47 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  29.41 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.02 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  29 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.07 
 
 
426 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  28.93 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  28.08 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1652  hypothetical protein  31.34 
 
 
355 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  28.86 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  30.89 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.37 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.63 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.03 
 
 
722 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  29.95 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0980  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.11 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  28.09 
 
 
413 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.44 
 
 
411 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  26.94 
 
 
426 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  27.9 
 
 
714 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  27.02 
 
 
441 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.98 
 
 
442 aa  126  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  30.28 
 
 
671 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0305  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  34.76 
 
 
216 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.82 
 
 
714 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  26.2 
 
 
445 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  30.66 
 
 
617 aa  124  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0607  hypothetical protein  28.91 
 
 
427 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.682532  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1071  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  27.59 
 
 
421 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.43 
 
 
722 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1994  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  32.83 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.27 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.54 
 
 
430 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  29.76 
 
 
435 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.66 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1009  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  27.41 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0798  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  27.41 
 
 
421 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0952  hypothetical protein  31.3 
 
 
365 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0249  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  30.57 
 
 
340 aa  120  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.237523  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.71 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2716  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.08 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0309  succinate dehydrogenase subunit B  32.77 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.24045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  25.71 
 
 
711 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.08 
 
 
543 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0285  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.7 
 
 
344 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.847816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  26.78 
 
 
712 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.14 
 
 
679 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11585  fumarate reductase iron-sulfur subunit frdB  35.34 
 
 
246 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0631351  normal  0.974631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2343  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.32 
 
 
344 aa  118  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.39 
 
 
447 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0253  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  30.74 
 
 
234 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  26.55 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  29.53 
 
 
663 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0128  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  30.19 
 
 
345 aa  117  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.579752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  26.44 
 
 
423 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.02 
 
 
661 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.8 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  27.34 
 
 
435 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  28.45 
 
 
661 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.12 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2231  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.04 
 
 
252 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  26.58 
 
 
711 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2789  fumarate reductase iron-sulfur subunit  32.47 
 
 
247 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.5 
 
 
662 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  27.64 
 
 
654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.59 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.74 
 
 
413 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0176  succinate dehydrogenase subunit B  31.32 
 
 
356 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.27 
 
 
661 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  29.01 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  27.09 
 
 
428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  28.26 
 
 
708 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  28.86 
 
 
588 aa  114  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  25.47 
 
 
711 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.21 
 
 
662 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  28.94 
 
 
639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>