More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0690 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  56.38 
 
 
717 aa  801    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.82 
 
 
708 aa  658    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  56.98 
 
 
711 aa  806    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1478    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  56.98 
 
 
711 aa  812    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  57.18 
 
 
711 aa  842    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  54.57 
 
 
730 aa  795    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  51.69 
 
 
710 aa  742    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  47.21 
 
 
716 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  46.98 
 
 
717 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  47.48 
 
 
721 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  47.91 
 
 
716 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  55.17 
 
 
712 aa  810    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  44.99 
 
 
717 aa  631  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  45.91 
 
 
713 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  45.92 
 
 
712 aa  622  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  40.72 
 
 
767 aa  531  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.47 
 
 
722 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  42.11 
 
 
489 aa  349  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  39.7 
 
 
470 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  39.48 
 
 
470 aa  339  9e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  39.48 
 
 
470 aa  339  9e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  39.48 
 
 
470 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  40.58 
 
 
470 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  40.13 
 
 
470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  40.24 
 
 
480 aa  320  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  38.29 
 
 
473 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 
475 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  41.07 
 
 
479 aa  317  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  40.35 
 
 
482 aa  317  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  30.7 
 
 
738 aa  317  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  37.55 
 
 
472 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  31.03 
 
 
741 aa  313  9e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  39.91 
 
 
477 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  39.91 
 
 
482 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  39.91 
 
 
477 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  39.91 
 
 
477 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  39.7 
 
 
482 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  39.91 
 
 
477 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  40.87 
 
 
482 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  40.85 
 
 
456 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  41.61 
 
 
490 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  43.44 
 
 
480 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  30.08 
 
 
741 aa  303  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  37.26 
 
 
476 aa  303  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  39.44 
 
 
481 aa  303  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  39.24 
 
 
484 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  42.67 
 
 
480 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  38.08 
 
 
475 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.14 
 
 
480 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  38.11 
 
 
481 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  43.73 
 
 
475 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  44.51 
 
 
486 aa  301  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  37.83 
 
 
481 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  37.86 
 
 
478 aa  300  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  41.28 
 
 
472 aa  300  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  36.15 
 
 
475 aa  299  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  38.76 
 
 
479 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  37.83 
 
 
481 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  28.48 
 
 
812 aa  296  8e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  36.21 
 
 
470 aa  296  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  35.36 
 
 
469 aa  296  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  35.36 
 
 
469 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  35.93 
 
 
471 aa  296  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 
476 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  30.65 
 
 
727 aa  295  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.93 
 
 
484 aa  295  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  43.8 
 
 
471 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.59 
 
 
471 aa  293  6e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  39.07 
 
 
481 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  36.85 
 
 
475 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  35.14 
 
 
469 aa  293  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  37.56 
 
 
479 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  39.02 
 
 
481 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  35.06 
 
 
470 aa  292  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  35.28 
 
 
471 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.55 
 
 
479 aa  292  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  34.49 
 
 
470 aa  292  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  34.85 
 
 
470 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  38.18 
 
 
470 aa  291  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.06 
 
 
470 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  39.18 
 
 
474 aa  291  3e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.71 
 
 
470 aa  291  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  37.08 
 
 
492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  37.16 
 
 
473 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0070  iron-sulfur cluster binding protein  42.98 
 
 
479 aa  289  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0111  iron-sulfur cluster binding protein  42.98 
 
 
479 aa  289  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  40.28 
 
 
480 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0085  iron-sulfur cluster binding protein  42.69 
 
 
479 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.42 
 
 
470 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  40.19 
 
 
471 aa  288  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  39.69 
 
 
463 aa  287  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  39.89 
 
 
481 aa  286  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  40.31 
 
 
464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  37.85 
 
 
494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  34.2 
 
 
470 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.67 
 
 
528 aa  284  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 
490 aa  284  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  39.01 
 
 
477 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.42 
 
 
470 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>