More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1031 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  66.34 
 
 
717 aa  1049    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  66.99 
 
 
716 aa  1048    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  64.06 
 
 
713 aa  974    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
717 aa  1501    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  57.97 
 
 
716 aa  893    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  65.92 
 
 
712 aa  1022    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  59.16 
 
 
721 aa  914    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.52 
 
 
708 aa  631  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  44.99 
 
 
714 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  41.91 
 
 
711 aa  621  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  42.98 
 
 
717 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  41.43 
 
 
712 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  41.9 
 
 
730 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  41.63 
 
 
711 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  41.85 
 
 
711 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  42.33 
 
 
710 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  36.6 
 
 
767 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33 
 
 
722 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  38.01 
 
 
475 aa  310  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  39.84 
 
 
479 aa  310  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  39.66 
 
 
472 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  39.47 
 
 
482 aa  308  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  37.98 
 
 
473 aa  306  9.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  36.44 
 
 
489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  37.71 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  38.42 
 
 
484 aa  303  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  38.8 
 
 
481 aa  303  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  37.68 
 
 
470 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  36.74 
 
 
470 aa  301  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  35.56 
 
 
469 aa  300  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  36.32 
 
 
475 aa  300  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  36.09 
 
 
470 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  43.7 
 
 
475 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  34.71 
 
 
469 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  40.31 
 
 
480 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  36.52 
 
 
470 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.11 
 
 
475 aa  299  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  36.93 
 
 
480 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  36.52 
 
 
470 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  34.93 
 
 
470 aa  298  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.64 
 
 
464 aa  298  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  37.41 
 
 
481 aa  297  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  34.91 
 
 
469 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  40.96 
 
 
486 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  36.64 
 
 
476 aa  294  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  37.39 
 
 
478 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  34.59 
 
 
470 aa  291  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.03 
 
 
470 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  35.24 
 
 
480 aa  291  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  35.6 
 
 
470 aa  291  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  37.87 
 
 
470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  37.12 
 
 
492 aa  290  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  29.92 
 
 
738 aa  290  6e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  34.35 
 
 
471 aa  290  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  33.98 
 
 
470 aa  290  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.98 
 
 
470 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.81 
 
 
470 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  35.24 
 
 
470 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  34.57 
 
 
471 aa  289  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.03 
 
 
470 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.03 
 
 
470 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  39.95 
 
 
456 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  28.87 
 
 
741 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 
481 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  37.24 
 
 
481 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  36.76 
 
 
496 aa  287  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 
480 aa  287  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  37.8 
 
 
522 aa  287  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  34.95 
 
 
477 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.53 
 
 
536 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  36.55 
 
 
481 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  36.55 
 
 
481 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  34.95 
 
 
482 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  37.53 
 
 
483 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.53 
 
 
483 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.53 
 
 
483 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  34.95 
 
 
477 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  37.53 
 
 
483 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  37.53 
 
 
483 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  28.69 
 
 
727 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  34.74 
 
 
482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  36.55 
 
 
481 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  35.48 
 
 
477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  35.48 
 
 
477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  37.27 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  38.52 
 
 
463 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  38.7 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  39.51 
 
 
471 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  33.75 
 
 
475 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  28.67 
 
 
741 aa  283  8.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  34.37 
 
 
482 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  35.91 
 
 
471 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.31 
 
 
480 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  28.27 
 
 
812 aa  281  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  33.54 
 
 
475 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  33.54 
 
 
475 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  33.54 
 
 
475 aa  280  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  35.31 
 
 
473 aa  280  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  33.54 
 
 
475 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  37.56 
 
 
490 aa  280  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>