More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3083 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  54.74 
 
 
711 aa  787    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.28 
 
 
708 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  56.38 
 
 
714 aa  802    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  56.16 
 
 
711 aa  785    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  44.71 
 
 
717 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  53.82 
 
 
730 aa  794    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  47.27 
 
 
710 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  56.58 
 
 
711 aa  786    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
717 aa  1494    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  54.33 
 
 
712 aa  771    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  44.27 
 
 
716 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  42.98 
 
 
717 aa  620  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  43.4 
 
 
716 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  43.86 
 
 
713 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  42.92 
 
 
721 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  43.28 
 
 
712 aa  598  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  40.17 
 
 
767 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.47 
 
 
722 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  40.51 
 
 
473 aa  350  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  39.87 
 
 
470 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 
489 aa  335  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  39.31 
 
 
470 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  36.91 
 
 
475 aa  331  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  37.55 
 
 
470 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  37.55 
 
 
470 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  37.34 
 
 
470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  41.94 
 
 
475 aa  319  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  37.12 
 
 
470 aa  318  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  31.1 
 
 
741 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  35.36 
 
 
473 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  39.53 
 
 
476 aa  314  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  36.86 
 
 
481 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  39.3 
 
 
482 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  39.3 
 
 
477 aa  311  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  39.3 
 
 
477 aa  311  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  39.3 
 
 
477 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  30.53 
 
 
741 aa  310  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  39.08 
 
 
482 aa  310  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  39.3 
 
 
477 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  34.11 
 
 
475 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  36.7 
 
 
475 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  37.63 
 
 
482 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  36.79 
 
 
476 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  37.39 
 
 
478 aa  301  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  37.39 
 
 
469 aa  301  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  35.42 
 
 
470 aa  300  8e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  36.08 
 
 
479 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  36.74 
 
 
479 aa  299  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  36.63 
 
 
471 aa  299  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  40.09 
 
 
471 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  35.19 
 
 
486 aa  297  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  39.24 
 
 
464 aa  296  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  29.08 
 
 
812 aa  296  7e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  34.9 
 
 
480 aa  296  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  39.35 
 
 
463 aa  296  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  31.1 
 
 
738 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  34.48 
 
 
472 aa  295  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  39.85 
 
 
481 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  40.16 
 
 
481 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  39.85 
 
 
481 aa  295  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  39.6 
 
 
481 aa  294  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  38.35 
 
 
490 aa  293  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  34.45 
 
 
475 aa  293  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  39.34 
 
 
481 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  38.4 
 
 
482 aa  293  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  34.45 
 
 
475 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  34.45 
 
 
475 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  34.45 
 
 
475 aa  293  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  36.55 
 
 
481 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  34.45 
 
 
475 aa  293  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  34.45 
 
 
475 aa  293  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  34.45 
 
 
475 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  34.45 
 
 
475 aa  293  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  33.05 
 
 
473 aa  291  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  34.48 
 
 
469 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  38.82 
 
 
480 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 
477 aa  290  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  39.24 
 
 
456 aa  290  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  33.91 
 
 
469 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 
481 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  34.24 
 
 
475 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
479 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  38.8 
 
 
484 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  36.97 
 
 
498 aa  288  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.88 
 
 
493 aa  287  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  33.76 
 
 
469 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  31.09 
 
 
727 aa  287  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  32.98 
 
 
474 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  38.75 
 
 
479 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  34.98 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2430  protein of unknown function DUF162  37.88 
 
 
481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.76 
 
 
470 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  36.46 
 
 
473 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  41.32 
 
 
480 aa  285  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  34.34 
 
 
470 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  35.6 
 
 
465 aa  283  7.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  33.62 
 
 
470 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.62 
 
 
470 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.62 
 
 
470 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  35.68 
 
 
473 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>