More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0390 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  54.08 
 
 		 716 aa  806    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  59.11 
 
 		 716 aa  896    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  47.48 
 
 		 714 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  58.18 
 
 		 712 aa  881    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  56.05 
 
 		 713 aa  848    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  58.47 
 
 		 717 aa  902    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  59.16 
 
 		 717 aa  914    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  100 
 
 		 721 aa  1471    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  46.24 
 
 		 730 aa  628  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.85 
 
 		 708 aa  622  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  44.83 
 
 		 711 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  43.4 
 
 		 711 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  44.97 
 
 		 711 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  43.62 
 
 		 712 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  42.78 
 
 		 717 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  43.99 
 
 		 710 aa  547  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  40.35 
 
 		 767 aa  511  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.93 
 
 		 722 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  43.08 
 
 		 490 aa  290  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  35.96 
 
 		 481 aa  289  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.94 
 
 		 480 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 		 475 aa  287  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  41.47 
 
 		 481 aa  286  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  46.75 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  38.65 
 
 		 476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  38.39 
 
 		 469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  38.65 
 
 		 478 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  43.52 
 
 		 473 aa  284  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  46.44 
 
 		 470 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  41.27 
 
 		 481 aa  283  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  40.2 
 
 		 479 aa  283  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  46.44 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  46.44 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  38.72 
 
 		 489 aa  282  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  41.32 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  39.76 
 
 		 469 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.48 
 
 		 470 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  45.2 
 
 		 482 aa  281  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  38.88 
 
 		 470 aa  281  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  41.27 
 
 		 486 aa  281  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  41.32 
 
 		 481 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  39.76 
 
 		 469 aa  280  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  36.89 
 
 		 470 aa  280  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  41.22 
 
 		 475 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  42.19 
 
 		 481 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  37.61 
 
 		 492 aa  277  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.99 
 
 		 475 aa  277  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  40.86 
 
 		 469 aa  277  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  31.09 
 
 		 738 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.95 
 
 		 463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  41.15 
 
 		 480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  38.37 
 
 		 481 aa  275  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  39.53 
 
 		 479 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0559  hypothetical protein  39.69 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  43.03 
 
 		 477 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  36.94 
 
 		 498 aa  271  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  41.24 
 
 		 480 aa  270  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  38.72 
 
 		 480 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.4 
 
 		 479 aa  269  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2430  protein of unknown function DUF162  40.71 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  40.16 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  39.36 
 
 		 472 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 		 480 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  36.53 
 
 		 496 aa  268  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  35.71 
 
 		 479 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.5 
 
 		 464 aa  266  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  39.85 
 
 		 522 aa  266  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.29 
 
 		 484 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  31.15 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  36.93 
 
 		 471 aa  266  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 		 471 aa  266  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  36.5 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  38.48 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.5 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  36.5 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  40.31 
 
 		 475 aa  265  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  39.79 
 
 		 483 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.79 
 
 		 483 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  39.79 
 
 		 483 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  39.79 
 
 		 483 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.79 
 
 		 483 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.79 
 
 		 536 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.7 
 
 		 470 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  40.7 
 
 		 458 aa  264  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.7 
 
 		 470 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  38.72 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.7 
 
 		 470 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  36.29 
 
 		 471 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  38.7 
 
 		 470 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  39.79 
 
 		 483 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0070  iron-sulfur cluster binding protein  39.13 
 
 		 479 aa  261  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  41.91 
 
 		 470 aa  261  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0111  iron-sulfur cluster binding protein  39.13 
 
 		 479 aa  260  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  38.01 
 
 		 466 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0085  iron-sulfur cluster binding protein  38.86 
 
 		 479 aa  260  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 		 484 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  36.88 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  42.14 
 
 		 472 aa  258  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  35.7 
 
 		 494 aa  258  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>