More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2911 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  51.12 
 
 		 708 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  56.98 
 
 		 714 aa  812    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  96.34 
 
 		 711 aa  1422    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  79.44 
 
 		 711 aa  1202    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  53.59 
 
 		 730 aa  766    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 711 aa  1462    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  55.82 
 
 		 717 aa  779    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  48.53 
 
 		 710 aa  659    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  75.67 
 
 		 712 aa  1146    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  44.55 
 
 		 717 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  44.83 
 
 		 721 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  41.85 
 
 		 717 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  44.26 
 
 		 716 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  44.76 
 
 		 716 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  43.42 
 
 		 712 aa  588  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  42.64 
 
 		 713 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  38.37 
 
 		 767 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 		 722 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  41.39 
 
 		 473 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  42.7 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  41.77 
 
 		 470 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  41.68 
 
 		 489 aa  345  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  37.64 
 
 		 470 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  37.42 
 
 		 470 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  37.42 
 
 		 470 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  37.2 
 
 		 470 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  39.56 
 
 		 472 aa  330  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  39.39 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.66 
 
 		 470 aa  324  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.66 
 
 		 480 aa  323  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  36.01 
 
 		 470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  36.3 
 
 		 469 aa  320  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  36.72 
 
 		 469 aa  319  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  35.36 
 
 		 480 aa  319  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 		 469 aa  317  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  35.95 
 
 		 470 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  36.29 
 
 		 475 aa  311  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  38.1 
 
 		 479 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  34.72 
 
 		 470 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  36.66 
 
 		 471 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.5 
 
 		 470 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  39.35 
 
 		 471 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  34.5 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  34.28 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.28 
 
 		 470 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.28 
 
 		 470 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  36.23 
 
 		 471 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.06 
 
 		 470 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  31.56 
 
 		 741 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  36.34 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  37.45 
 
 		 479 aa  304  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  37.53 
 
 		 478 aa  299  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  36.34 
 
 		 522 aa  299  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  31.02 
 
 		 741 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  35.81 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.21 
 
 		 463 aa  298  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  36.62 
 
 		 493 aa  297  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  36.62 
 
 		 493 aa  297  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  37.53 
 
 		 475 aa  296  8e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 		 481 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  37.97 
 
 		 496 aa  296  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.91 
 
 		 475 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  37.27 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  39.06 
 
 		 477 aa  295  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  37.8 
 
 		 481 aa  295  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  36.21 
 
 		 475 aa  294  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  38.16 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  36.38 
 
 		 458 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  36 
 
 		 501 aa  293  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  38.73 
 
 		 490 aa  293  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  34.84 
 
 		 483 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  37.8 
 
 		 481 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  40.05 
 
 		 472 aa  293  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  36.08 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  37.09 
 
 		 481 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  38.73 
 
 		 469 aa  293  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  34.99 
 
 		 482 aa  292  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.84 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  36.23 
 
 		 475 aa  292  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.84 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  34.84 
 
 		 483 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  38.32 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  34.84 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.84 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.84 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  38 
 
 		 486 aa  292  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  36.9 
 
 		 475 aa  291  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  36.19 
 
 		 494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  35.56 
 
 		 528 aa  290  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  37.6 
 
 		 479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  36.9 
 
 		 475 aa  290  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  36.9 
 
 		 475 aa  290  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  36.9 
 
 		 475 aa  290  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  36.9 
 
 		 475 aa  290  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  38.48 
 
 		 465 aa  290  9e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  35.89 
 
 		 478 aa  290  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 		 475 aa  289  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  36.29 
 
 		 477 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  36.29 
 
 		 477 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  29.05 
 
 		 812 aa  289  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>