270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3823 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 463 aa  961    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  61.14 
 
 		 458 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  62.42 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  47.65 
 
 		 471 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  43.39 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  44.55 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  41.38 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  41.38 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  41.16 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  41.16 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  43.56 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  44.74 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  41.16 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  43.62 
 
 		 489 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  42.19 
 
 		 479 aa  363  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  39.56 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  39.14 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 		 475 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  39.14 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  41.88 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  39.14 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  44.23 
 
 		 480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  39.35 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  41.75 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  40.89 
 
 		 481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  43.78 
 
 		 465 aa  350  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  38.68 
 
 		 469 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  39.1 
 
 		 469 aa  349  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  39.4 
 
 		 478 aa  348  9e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  39.75 
 
 		 479 aa  345  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  40.17 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  42.82 
 
 		 492 aa  343  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  40.93 
 
 		 481 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  42.23 
 
 		 486 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  40.66 
 
 		 474 aa  341  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 		 473 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  41.52 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  39.02 
 
 		 481 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  41.73 
 
 		 484 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  38.79 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  46.65 
 
 		 475 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  38.75 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.37 
 
 		 475 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  39.29 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  38.58 
 
 		 481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  38.79 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  40.05 
 
 		 474 aa  335  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  38.35 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.28 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  37.63 
 
 		 471 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  40.42 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  40.28 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  38.35 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1396  hypothetical protein  42.44 
 
 		 465 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  37.63 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  38.49 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  40.98 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  38.53 
 
 		 475 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 		 479 aa  331  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  38.74 
 
 		 475 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  38.71 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  39.22 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  39.22 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  37.2 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.42 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  41.04 
 
 		 493 aa  330  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  45.7 
 
 		 470 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 476 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  42 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  40.41 
 
 		 458 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.75 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  42.34 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  41.82 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  40.28 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  39.39 
 
 		 475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  40.82 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  36.56 
 
 		 510 aa  325  8.000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  39.2 
 
 		 475 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  36.72 
 
 		 473 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  43.52 
 
 		 473 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  43.52 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  43.52 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  43.52 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  43.52 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  43.52 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  43.52 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  36.46 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  39.17 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  41.45 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  41.82 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  41.14 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  38.6 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  36.78 
 
 		 485 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  43.26 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  43.26 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  40.97 
 
 		 459 aa  323  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>