234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2947 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.78 
 
 		 467 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  70.9 
 
 		 458 aa  705    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 458 aa  964    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  72.12 
 
 		 459 aa  707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  73.52 
 
 		 457 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  59.61 
 
 		 465 aa  563  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  58.14 
 
 		 458 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  57.69 
 
 		 458 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  56.89 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  58.28 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  58.29 
 
 		 458 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  52.65 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  52.2 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  51.2 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.78 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  51.1 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  53.12 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.1 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  53.12 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  52.32 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  53.12 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  51.1 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  54.04 
 
 		 523 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  51.2 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.32 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.1 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  52.69 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.32 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.78 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  49.78 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.44 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  49.78 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  50.22 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  49.56 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  43.08 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  43.18 
 
 		 501 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  42.66 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  43.18 
 
 		 494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  43.18 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  43.18 
 
 		 493 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  42.44 
 
 		 470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  42.44 
 
 		 470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  42.44 
 
 		 470 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  42.76 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  41.3 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  42.37 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  43.41 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  40.52 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  42.54 
 
 		 528 aa  344  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  42.2 
 
 		 463 aa  342  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  41.91 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  41.48 
 
 		 479 aa  339  8e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  43.05 
 
 		 481 aa  338  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  39.59 
 
 		 475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  39.59 
 
 		 475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  40.94 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  43.53 
 
 		 545 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  42.27 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  39.36 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  39.36 
 
 		 475 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  41.8 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 475 aa  335  7.999999999999999e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  42.92 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.36 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  39.36 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  40.94 
 
 		 510 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  42.21 
 
 		 475 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  37.42 
 
 		 473 aa  333  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  42.27 
 
 		 484 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  42.27 
 
 		 484 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  42.27 
 
 		 484 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  42.99 
 
 		 498 aa  332  9e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  42.03 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  41.5 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  42.33 
 
 		 473 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  326  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  41.14 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.31 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  41.42 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  40.59 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  39.77 
 
 		 493 aa  323  6e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  41.15 
 
 		 486 aa  322  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  39.64 
 
 		 512 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  38.9 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.4 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  42.64 
 
 		 481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  39.32 
 
 		 482 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  40.22 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  39.66 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  39.66 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>