More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4211 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  73.78 
 
 
458 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
467 aa  983    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  73.33 
 
 
457 aa  711    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  71.27 
 
 
458 aa  716    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  73.07 
 
 
459 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  59.61 
 
 
465 aa  579  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  57.49 
 
 
458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  56.24 
 
 
458 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  56.82 
 
 
458 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  56.33 
 
 
466 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  56.83 
 
 
458 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  51.33 
 
 
457 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  52 
 
 
464 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  51.78 
 
 
464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  51.45 
 
 
524 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.33 
 
 
462 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  51.22 
 
 
524 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  50.44 
 
 
524 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  51.89 
 
 
523 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  49.45 
 
 
457 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  50.66 
 
 
477 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.22 
 
 
464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  48.9 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  53.41 
 
 
428 aa  468  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  47.73 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.34 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.22 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.44 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  48.55 
 
 
464 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  48.55 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  48.33 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  48.55 
 
 
464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.78 
 
 
464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.55 
 
 
464 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  42.27 
 
 
470 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  42.05 
 
 
470 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  41.82 
 
 
470 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  41.82 
 
 
470 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.59 
 
 
475 aa  347  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
479 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  41.04 
 
 
472 aa  343  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  39.23 
 
 
475 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  39.23 
 
 
475 aa  342  9e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  39.23 
 
 
475 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.23 
 
 
475 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 
475 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 
463 aa  340  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 
475 aa  339  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 
475 aa  338  9e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 
475 aa  338  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  38.53 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  38.61 
 
 
473 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  39.49 
 
 
470 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  41.75 
 
 
456 aa  335  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  41.04 
 
 
475 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  40.67 
 
 
485 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  40.18 
 
 
496 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  39.69 
 
 
501 aa  333  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  39.64 
 
 
493 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  39.64 
 
 
493 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  40.42 
 
 
463 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  39.19 
 
 
480 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  38.58 
 
 
467 aa  329  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  39.18 
 
 
475 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  39.37 
 
 
479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  42.14 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.48 
 
 
464 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  41.06 
 
 
473 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  40.83 
 
 
473 aa  326  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  37.64 
 
 
473 aa  325  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.11 
 
 
528 aa  325  8.000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  40.76 
 
 
498 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  40.82 
 
 
484 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 
474 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  40.82 
 
 
484 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
476 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  40.82 
 
 
484 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  37.36 
 
 
475 aa  324  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  38.83 
 
 
479 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  38.36 
 
 
470 aa  323  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.07 
 
 
545 aa  323  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  44.66 
 
 
481 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  45.51 
 
 
481 aa  322  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  39.45 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  38.31 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  39.78 
 
 
481 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  38.9 
 
 
476 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  40.41 
 
 
478 aa  319  7e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  38.8 
 
 
486 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  38.28 
 
 
470 aa  316  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>