224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5428 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  68.78 
 
 		 523 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  97.63 
 
 		 464 aa  950    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  67.99 
 
 		 524 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  70.11 
 
 		 457 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 464 aa  975    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  64.98 
 
 		 477 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  67.55 
 
 		 524 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  66.96 
 
 		 524 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  52.65 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  54.03 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  50.99 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  52.21 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  51.01 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  50.78 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  51.45 
 
 		 458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  50.66 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  50.76 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  50.22 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  49.22 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  48.12 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.35 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  47.7 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.01 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  47.89 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  47.89 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.67 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  47.67 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.96 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  47.45 
 
 		 464 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.01 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.45 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  47.65 
 
 		 428 aa  398  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  40.23 
 
 		 470 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  39.77 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.43 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  38.69 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  38.69 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  38.69 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.35 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  39.68 
 
 		 476 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 		 475 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  38.1 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  37.92 
 
 		 475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  39.68 
 
 		 470 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  37.9 
 
 		 473 aa  302  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  38.37 
 
 		 485 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  37.94 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  38.01 
 
 		 475 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  39.33 
 
 		 475 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  37.31 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  37.61 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  40.18 
 
 		 463 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  38.96 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  39.33 
 
 		 470 aa  296  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  36.22 
 
 		 494 aa  295  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  37.69 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  40.87 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  38.44 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  37.69 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  37.11 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  37.11 
 
 		 493 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  36.38 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  37.69 
 
 		 482 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  38.84 
 
 		 473 aa  294  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  38.19 
 
 		 486 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  38.14 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  37.69 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  38.14 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  38.62 
 
 		 473 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 		 474 aa  292  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  38.68 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  36.99 
 
 		 475 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  40.05 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  37.04 
 
 		 473 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  43.14 
 
 		 481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  37.09 
 
 		 496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  39.33 
 
 		 479 aa  289  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  38.88 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  38.74 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 		 481 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  36.76 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  39.53 
 
 		 481 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  36.88 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1396  hypothetical protein  39.81 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>