More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1269 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  94.41 
 
 
465 aa  924    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  95.47 
 
 
464 aa  914    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  91.81 
 
 
464 aa  884    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  95.69 
 
 
464 aa  915    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  87.67 
 
 
462 aa  851    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
464 aa  971    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  92.89 
 
 
464 aa  909    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  93.75 
 
 
464 aa  894    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  84.4 
 
 
462 aa  810    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  95.47 
 
 
464 aa  914    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  93.1 
 
 
464 aa  890    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  80 
 
 
466 aa  770    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  88.25 
 
 
457 aa  855    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  86.47 
 
 
457 aa  814    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  55.83 
 
 
458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  55.38 
 
 
458 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  50.99 
 
 
458 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  54.77 
 
 
458 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  51.77 
 
 
465 aa  482  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  54.94 
 
 
458 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  51.32 
 
 
458 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  51.33 
 
 
457 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  50.45 
 
 
459 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  54.33 
 
 
428 aa  458  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.55 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  51.33 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  49.19 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  47.99 
 
 
457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  48.73 
 
 
524 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  48.73 
 
 
524 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  47.67 
 
 
464 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  48.27 
 
 
523 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  46.56 
 
 
464 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  45.11 
 
 
477 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.36 
 
 
475 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  39.35 
 
 
479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  39.11 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  39.41 
 
 
475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  39.82 
 
 
475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 
475 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  39.32 
 
 
476 aa  312  7.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  43.56 
 
 
480 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 
501 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 
473 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 
490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  38.25 
 
 
475 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 
475 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 
475 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  38.25 
 
 
475 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 
475 aa  310  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 
475 aa  310  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  36.75 
 
 
494 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 
470 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  38.78 
 
 
498 aa  307  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  39.08 
 
 
474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  37.02 
 
 
493 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  37.02 
 
 
493 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  37.89 
 
 
479 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  38.36 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  40.63 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  43.39 
 
 
475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  36.93 
 
 
473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  36.67 
 
 
528 aa  303  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  38.74 
 
 
476 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  37.89 
 
 
478 aa  303  6.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  37.56 
 
 
475 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  37.33 
 
 
475 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.24 
 
 
545 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  38.53 
 
 
486 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 
485 aa  299  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.36 
 
 
493 aa  299  8e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  38.12 
 
 
473 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 
484 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 
484 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 
484 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  38.72 
 
 
482 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 
477 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 
477 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  38.2 
 
 
481 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 
477 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  38.72 
 
 
477 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  38.11 
 
 
471 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  36.61 
 
 
479 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  38.13 
 
 
482 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  42.28 
 
 
477 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  38.58 
 
 
496 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  38.19 
 
 
470 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  41.41 
 
 
475 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  36.11 
 
 
464 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  36.05 
 
 
470 aa  295  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  37.97 
 
 
470 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  36.4 
 
 
472 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  38.11 
 
 
471 aa  293  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  36.95 
 
 
473 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  36.95 
 
 
473 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  36.95 
 
 
473 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  36.95 
 
 
473 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  38.58 
 
 
482 aa  293  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>