More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1519 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  93.12 
 
 		 465 aa  914    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 464 aa  970    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  93.53 
 
 		 464 aa  897    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  91.81 
 
 		 464 aa  885    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  93.53 
 
 		 464 aa  896    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  96.34 
 
 		 464 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  96.34 
 
 		 464 aa  917    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  86.21 
 
 		 462 aa  817    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  93.75 
 
 		 464 aa  898    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  97.63 
 
 		 464 aa  931    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  80.44 
 
 		 466 aa  768    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  87.58 
 
 		 457 aa  823    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  89.58 
 
 		 457 aa  860    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  88.55 
 
 		 462 aa  855    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  55.83 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  55.16 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  55.86 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  54.89 
 
 		 458 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  51.33 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  50.89 
 
 		 457 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  49.67 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  50.22 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.55 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  49.1 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  54.57 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  51.1 
 
 		 466 aa  448  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  48.75 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  47.58 
 
 		 524 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  48.04 
 
 		 523 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  47.11 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  47.45 
 
 		 464 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  47.11 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  46.56 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  46 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  40.09 
 
 		 475 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  38.71 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  39.63 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 		 475 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.36 
 
 		 475 aa  312  9e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  38.51 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  38.25 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  38.25 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 		 480 aa  309  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  39.86 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  36.32 
 
 		 494 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  37.19 
 
 		 493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  37.19 
 
 		 493 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 476 aa  306  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  37 
 
 		 501 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  37.1 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  39.18 
 
 		 498 aa  303  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 		 474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  37.18 
 
 		 475 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  37.78 
 
 		 473 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  37.67 
 
 		 472 aa  302  7.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  39.86 
 
 		 475 aa  302  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  42.74 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  38.08 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  38.96 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  36.05 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  38.91 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  39.33 
 
 		 486 aa  299  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  39.81 
 
 		 456 aa  299  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  38.69 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  37.72 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  36.42 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  37.78 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  37.78 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  37.95 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  37.78 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  39.09 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  39.09 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  39.09 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  39.09 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  38.82 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  39.01 
 
 		 545 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  39.09 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  39.09 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  38.46 
 
 		 470 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  38.46 
 
 		 470 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.47 
 
 		 493 aa  296  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  42.86 
 
 		 475 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  38.99 
 
 		 476 aa  295  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  36.76 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  36.76 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  36.76 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  36.76 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  36.76 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  36.76 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  37.22 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  38.5 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  36.54 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>