255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3623 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 465 aa  966    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  65.25 
 
 		 458 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  65.02 
 
 		 458 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  65.02 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  61.5 
 
 		 458 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.61 
 
 		 467 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  64.77 
 
 		 458 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  61.28 
 
 		 457 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  60.18 
 
 		 459 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  59.61 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  58.84 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.3 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  54.3 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  53.39 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  52.21 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.21 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  51.33 
 
 		 457 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  52.77 
 
 		 524 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  52.99 
 
 		 524 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.89 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  51.68 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.43 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.81 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  52.33 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  55.45 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  51.87 
 
 		 523 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  51.33 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  51.11 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  51.11 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.77 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.77 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  50.88 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  50.44 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  50.22 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  42.89 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  42.55 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  43.38 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  45.27 
 
 		 470 aa  352  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  41.8 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  41.8 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  43.68 
 
 		 456 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  41.8 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  45.03 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  42.74 
 
 		 482 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  41.8 
 
 		 475 aa  351  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  45.03 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  45.03 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  43.78 
 
 		 463 aa  350  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 475 aa  349  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 475 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  44.42 
 
 		 482 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  44.42 
 
 		 477 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  44.42 
 
 		 477 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  41.8 
 
 		 475 aa  348  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  44.42 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  44.1 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  41.11 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  44.42 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.54 
 
 		 528 aa  348  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  41.36 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  41.89 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  43.12 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  44.19 
 
 		 475 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  41.43 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  40.78 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  42.83 
 
 		 479 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  43.27 
 
 		 471 aa  343  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  41.36 
 
 		 490 aa  342  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  46.58 
 
 		 476 aa  342  7e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  42.01 
 
 		 475 aa  342  8e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  44.12 
 
 		 475 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  42.38 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  41.68 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  41.76 
 
 		 470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.45 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  40.82 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  44.06 
 
 		 476 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  40.49 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  40.43 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  42.83 
 
 		 493 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  43.26 
 
 		 490 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  44.72 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  43.39 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  41.86 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  42.6 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  42.15 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  41.36 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  41.11 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  42.05 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  40.04 
 
 		 510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  42.09 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  42.09 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  42.09 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  43.37 
 
 		 473 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  43.37 
 
 		 473 aa  326  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  41.34 
 
 		 474 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  43.15 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>