242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0932 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 458 aa  964    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  61.14 
 
 		 463 aa  612  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  58.46 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  45.45 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  44.57 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  44.2 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  44.91 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  41.33 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  45.28 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  44.65 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  40.87 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  37.96 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  37.96 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  37.74 
 
 		 470 aa  364  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  37.96 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  39.66 
 
 		 469 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  39.66 
 
 		 469 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  42.96 
 
 		 480 aa  354  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  39.87 
 
 		 470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.13 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  39.13 
 
 		 475 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  38.38 
 
 		 469 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  41.5 
 
 		 475 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 475 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 475 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 475 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  41.04 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  41.29 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  41.29 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  42.11 
 
 		 481 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 475 aa  349  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 475 aa  349  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 		 475 aa  349  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  39.78 
 
 		 470 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  41.33 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  39.39 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  39.87 
 
 		 481 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  42.28 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  39.86 
 
 		 484 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  37.61 
 
 		 473 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  39.83 
 
 		 471 aa  342  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 		 473 aa  342  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  41.36 
 
 		 481 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  40.32 
 
 		 486 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  41.68 
 
 		 465 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  38.31 
 
 		 470 aa  340  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  39.21 
 
 		 481 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  36.32 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  41.27 
 
 		 481 aa  340  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  39.61 
 
 		 475 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  38.22 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  38.22 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.8 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.8 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  38.8 
 
 		 470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  39.92 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  38.8 
 
 		 470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  41.9 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  40.19 
 
 		 474 aa  335  9e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  42.28 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  39.19 
 
 		 522 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.02 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  38.8 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  41.67 
 
 		 482 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.58 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  41.67 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  35.96 
 
 		 478 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1396  hypothetical protein  42.45 
 
 		 465 aa  332  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.7 
 
 		 480 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  37.92 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 475 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  39.17 
 
 		 490 aa  330  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  40.95 
 
 		 482 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  41.19 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  42.62 
 
 		 458 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  44.7 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.88 
 
 		 536 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  41.88 
 
 		 483 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.88 
 
 		 483 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  41.88 
 
 		 483 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.88 
 
 		 483 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>