273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1606 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  74.89 
 
 
483 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  93.16 
 
 
469 aa  912    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  80.3 
 
 
470 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  74.89 
 
 
483 aa  728    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  80.3 
 
 
470 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  87.21 
 
 
470 aa  853    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  74.68 
 
 
483 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  80.52 
 
 
470 aa  784    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  74.89 
 
 
483 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  80.26 
 
 
470 aa  797    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  79.87 
 
 
471 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  76.61 
 
 
522 aa  742    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  79.23 
 
 
471 aa  785    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  87.45 
 
 
470 aa  852    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
469 aa  970    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  80.3 
 
 
470 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  79.44 
 
 
470 aa  777    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  80.74 
 
 
470 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  80.3 
 
 
470 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  74.89 
 
 
483 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  98.08 
 
 
469 aa  956    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  74.89 
 
 
483 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  74.89 
 
 
536 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.08 
 
 
480 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  48.63 
 
 
478 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  49.57 
 
 
475 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  49.68 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  48.21 
 
 
476 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  47.13 
 
 
490 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  45.74 
 
 
473 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  46.64 
 
 
482 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  46.42 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  46.09 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  46.42 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  46.09 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  46.42 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  46.2 
 
 
482 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2430  protein of unknown function DUF162  45.43 
 
 
481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182223 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  43.82 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  41.03 
 
 
475 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  40.81 
 
 
476 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0559  hypothetical protein  46.62 
 
 
488 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  44.23 
 
 
470 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  41.65 
 
 
470 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  41.43 
 
 
470 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  41.43 
 
 
470 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  39.83 
 
 
473 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  41 
 
 
470 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  39.03 
 
 
475 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  41.06 
 
 
469 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  40.8 
 
 
474 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 
470 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  38.77 
 
 
475 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  38.77 
 
 
475 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  38.77 
 
 
475 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.77 
 
 
475 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 
473 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  38.77 
 
 
475 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  43.72 
 
 
489 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  38.77 
 
 
475 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  39.83 
 
 
475 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.77 
 
 
475 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  41.3 
 
 
486 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 
473 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  41.45 
 
 
473 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  38.35 
 
 
475 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  41.79 
 
 
482 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  41.79 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  41.79 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  41.79 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  41.79 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  41.79 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  41.79 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  42 
 
 
476 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.54 
 
 
463 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
473 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  41.79 
 
 
473 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
473 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  38.41 
 
 
470 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 
479 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  41.26 
 
 
484 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  40.93 
 
 
464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  43.46 
 
 
475 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.3 
 
 
479 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  41.24 
 
 
492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  39.66 
 
 
458 aa  355  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  42.37 
 
 
472 aa  354  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.5 
 
 
475 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  42.03 
 
 
481 aa  352  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 
477 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  39.63 
 
 
475 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  39.87 
 
 
480 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  40.29 
 
 
481 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  38.68 
 
 
463 aa  349  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  40.25 
 
 
480 aa  349  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  40.08 
 
 
481 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  38.83 
 
 
480 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  40.84 
 
 
481 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  40.63 
 
 
481 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>