234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2925 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2430  protein of unknown function DUF162  67.39 
 
 		 481 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182223 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 471 aa  959    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  70.13 
 
 		 469 aa  682    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0559  hypothetical protein  67.59 
 
 		 488 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.2 
 
 		 479 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  55.56 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  53.7 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  55.96 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  55.37 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  55.96 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  55.16 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  55.37 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  54.74 
 
 		 482 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  55.31 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  54.85 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  54.72 
 
 		 490 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  50.75 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  50.11 
 
 		 473 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  46.85 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.42 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.42 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  46.2 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.99 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.99 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  45.99 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.45 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  45.02 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  44.25 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  43.82 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  44.03 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  46.45 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  45.02 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  45.02 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  44.03 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  45.84 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.37 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  45.84 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  45.84 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  45.84 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  45.84 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  45.84 
 
 		 536 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  45.63 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  44.68 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  41.19 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  41.4 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  41.19 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  41.4 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  39.96 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  44.81 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  39.96 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  44.59 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  45.57 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  42.89 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  39.75 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  45.68 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  45.47 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  38.82 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  45.05 
 
 		 481 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  39.75 
 
 		 474 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  39.75 
 
 		 475 aa  362  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  42.65 
 
 		 480 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  41.97 
 
 		 480 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  44.08 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  46.6 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  43.66 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  38.64 
 
 		 470 aa  359  7e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  42.98 
 
 		 464 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  43.25 
 
 		 481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  43.13 
 
 		 477 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  42.55 
 
 		 481 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  46.06 
 
 		 475 aa  353  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  39.06 
 
 		 473 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  41.93 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  40.72 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  41.43 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  40.55 
 
 		 492 aa  348  9e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  38.51 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  38.72 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  39.1 
 
 		 475 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  38.3 
 
 		 473 aa  346  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  39.96 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  41.54 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  43.27 
 
 		 465 aa  343  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  39.66 
 
 		 476 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  39.83 
 
 		 458 aa  342  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  38.38 
 
 		 476 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>