260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3931 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  70.95 
 
 
457 aa  695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
459 aa  963    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  72.12 
 
 
458 aa  707    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.07 
 
 
467 aa  717    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  73.68 
 
 
458 aa  741    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  60.18 
 
 
465 aa  570  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  59.23 
 
 
458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  59.01 
 
 
458 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  59.46 
 
 
458 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  56.04 
 
 
466 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  55.63 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  51.99 
 
 
477 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  52.68 
 
 
524 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  52.9 
 
 
524 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  52.23 
 
 
524 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  49.67 
 
 
457 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  52.01 
 
 
523 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  50.78 
 
 
464 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  50.45 
 
 
465 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.67 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  50.33 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  49.78 
 
 
457 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  49.67 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.78 
 
 
464 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.56 
 
 
457 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  49.33 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  49.33 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
464 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.45 
 
 
464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  49.1 
 
 
464 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  50 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  49.1 
 
 
464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.34 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.78 
 
 
464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  44.49 
 
 
479 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  42.56 
 
 
470 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.97 
 
 
475 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  41.26 
 
 
467 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  42.38 
 
 
496 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  42.14 
 
 
472 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  40.64 
 
 
470 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  42.47 
 
 
473 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  42.47 
 
 
473 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  42.47 
 
 
473 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  43.38 
 
 
484 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  43.38 
 
 
484 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  43.38 
 
 
484 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  42.24 
 
 
473 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  42.24 
 
 
473 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  42.24 
 
 
473 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  42.24 
 
 
473 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  42.24 
 
 
473 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  42.24 
 
 
473 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  42.92 
 
 
478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  40.41 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  42.24 
 
 
473 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  40.18 
 
 
470 aa  339  7e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  40.18 
 
 
470 aa  339  7e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  40.86 
 
 
501 aa  338  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  41.86 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  42.5 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.19 
 
 
463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  42.69 
 
 
473 aa  336  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  40.36 
 
 
490 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  40.32 
 
 
494 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  40.63 
 
 
493 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  40.63 
 
 
493 aa  333  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  40.36 
 
 
528 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.46 
 
 
493 aa  332  9e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  40.23 
 
 
475 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  40.23 
 
 
475 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
475 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  41.27 
 
 
476 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  40.23 
 
 
475 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  40.23 
 
 
475 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  40.32 
 
 
512 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  39.91 
 
 
464 aa  330  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  40.04 
 
 
471 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
475 aa  330  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  38.94 
 
 
478 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  41.59 
 
 
486 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  39.26 
 
 
473 aa  328  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  42.26 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  42.14 
 
 
475 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.63 
 
 
545 aa  326  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
473 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  40.97 
 
 
463 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.66 
 
 
484 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  41.42 
 
 
498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  40.34 
 
 
475 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  39.45 
 
 
479 aa  319  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  41.44 
 
 
475 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 
477 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
482 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  38.15 
 
 
480 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  39.24 
 
 
473 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 
477 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>