219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1754 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  66.33 
 
 
501 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  67 
 
 
545 aa  634    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  71.46 
 
 
484 aa  673    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  71.46 
 
 
484 aa  673    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 
512 aa  1043    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  67.35 
 
 
490 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  71.46 
 
 
484 aa  673    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  65 
 
 
494 aa  631  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  65.93 
 
 
493 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  65.73 
 
 
528 aa  629  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  65.73 
 
 
493 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  65.79 
 
 
475 aa  624  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  66.94 
 
 
485 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  64.05 
 
 
510 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  63.76 
 
 
496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  67.09 
 
 
467 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  64.37 
 
 
481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  65.83 
 
 
478 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  65.24 
 
 
493 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  64.9 
 
 
475 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  62.8 
 
 
470 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  66.88 
 
 
479 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  64.45 
 
 
486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  62.76 
 
 
479 aa  566  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12940  (4Fe-4S) cluster-containing protein  63.32 
 
 
509 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  61.22 
 
 
498 aa  541  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2424  protein of unknown function DUF162  51.47 
 
 
479 aa  412  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00298547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  41.56 
 
 
470 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  41.35 
 
 
470 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  41.35 
 
 
470 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  41.35 
 
 
470 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  45.3 
 
 
470 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  43.79 
 
 
473 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  45.51 
 
 
470 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  42.49 
 
 
475 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 
475 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  42.49 
 
 
475 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  44.68 
 
 
473 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  44.51 
 
 
464 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 
475 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 
475 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  44.56 
 
 
489 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  44.96 
 
 
475 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  40.76 
 
 
473 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  42.07 
 
 
475 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  40.95 
 
 
475 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  44.09 
 
 
472 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  42.07 
 
 
475 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 
475 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 
475 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  39.92 
 
 
473 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  41.67 
 
 
476 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  362  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  362  9e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  362  9e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  362  9e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  362  9e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  362  9e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  42 
 
 
480 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 
473 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  41.51 
 
 
470 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  39.22 
 
 
473 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  43.86 
 
 
482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  43.86 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  43.86 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  41.09 
 
 
474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  43.35 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  40.91 
 
 
486 aa  356  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  43.43 
 
 
482 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  41.61 
 
 
482 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  43.64 
 
 
477 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  43.64 
 
 
477 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  43.74 
 
 
472 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  43.28 
 
 
478 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  40.68 
 
 
476 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  43.43 
 
 
482 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  43.16 
 
 
480 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45 
 
 
484 aa  352  8e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  41.75 
 
 
481 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  44.21 
 
 
463 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  40.67 
 
 
484 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  42.92 
 
 
477 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  42.19 
 
 
475 aa  346  7e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  41.82 
 
 
457 aa  346  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
475 aa  346  7e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 
480 aa  345  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  40.04 
 
 
474 aa  344  2.9999999999999997e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  40.88 
 
 
479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.79 
 
 
471 aa  342  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  40.25 
 
 
481 aa  340  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  44.8 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  44.29 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  41.42 
 
 
481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  40.42 
 
 
475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  47.16 
 
 
481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  40.99 
 
 
459 aa  336  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  40.38 
 
 
492 aa  335  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  41.42 
 
 
480 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>