230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2594 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  71.22 
 
 
470 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  70.02 
 
 
481 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
475 aa  959    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  67.23 
 
 
493 aa  624  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  66.38 
 
 
478 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  64.99 
 
 
485 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  63.43 
 
 
496 aa  591  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  65.55 
 
 
475 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  65.21 
 
 
486 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  61.52 
 
 
528 aa  585  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  64.9 
 
 
512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  65.26 
 
 
479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  60.44 
 
 
494 aa  571  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  59.84 
 
 
501 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  61.49 
 
 
479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  59.36 
 
 
493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  59.36 
 
 
493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  62.55 
 
 
545 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  60.53 
 
 
484 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  60.53 
 
 
484 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  60.53 
 
 
484 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  57.69 
 
 
490 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  61.86 
 
 
510 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  62.96 
 
 
467 aa  538  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12940  (4Fe-4S) cluster-containing protein  61.3 
 
 
509 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  60.38 
 
 
498 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2424  protein of unknown function DUF162  49.69 
 
 
479 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00298547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  43.2 
 
 
472 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  40.97 
 
 
476 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  45.49 
 
 
473 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  42.53 
 
 
470 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 
470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  39.79 
 
 
470 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  39.79 
 
 
470 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  39.79 
 
 
470 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  42.83 
 
 
470 aa  349  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  40.99 
 
 
480 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  43.16 
 
 
490 aa  347  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  41.4 
 
 
475 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  40.08 
 
 
473 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  42.32 
 
 
478 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  43.96 
 
 
482 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 
473 aa  342  9e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  43.39 
 
 
463 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  43.52 
 
 
482 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  43.33 
 
 
482 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.41 
 
 
484 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  39.38 
 
 
475 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  43.71 
 
 
477 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  43.5 
 
 
477 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  40.04 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  44.07 
 
 
489 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  43.71 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  43.71 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  40.26 
 
 
475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  40.26 
 
 
475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  42.65 
 
 
476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
475 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  38.2 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  43.28 
 
 
475 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
475 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
475 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  38.49 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.76 
 
 
464 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  38.49 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  38.49 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  38.49 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  38.49 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  41.54 
 
 
482 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  38.49 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  38.49 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.04 
 
 
467 aa  334  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 
476 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  40.04 
 
 
475 aa  333  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  42.05 
 
 
479 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  38.28 
 
 
473 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  42.21 
 
 
458 aa  333  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  38.28 
 
 
473 aa  333  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  43.02 
 
 
458 aa  333  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  45.02 
 
 
458 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  42.46 
 
 
475 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  41.88 
 
 
484 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  42.03 
 
 
480 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  37.79 
 
 
473 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  42.37 
 
 
475 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  41.85 
 
 
477 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  44.62 
 
 
458 aa  329  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  39.39 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  42.14 
 
 
459 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  42.53 
 
 
472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  39.04 
 
 
486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  37.76 
 
 
470 aa  326  6e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  42.63 
 
 
457 aa  325  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  42.74 
 
 
471 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  39.87 
 
 
474 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  46.67 
 
 
481 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  45.36 
 
 
481 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  45.96 
 
 
481 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>