228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  68.14 
 
 
475 aa  638    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  68.93 
 
 
493 aa  730    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  100 
 
 
545 aa  1108    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  69.13 
 
 
493 aa  731    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  67.94 
 
 
490 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  72.73 
 
 
484 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  67 
 
 
512 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  69.83 
 
 
494 aa  735    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  72.73 
 
 
484 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  72.14 
 
 
510 aa  750    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  67.92 
 
 
501 aa  735    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  72.73 
 
 
484 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  62.94 
 
 
528 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  67.7 
 
 
479 aa  628  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  65.83 
 
 
478 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  67.86 
 
 
485 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  66.74 
 
 
493 aa  617  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  66.04 
 
 
496 aa  616  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  66.46 
 
 
486 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  66.6 
 
 
481 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  65.47 
 
 
470 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  65.45 
 
 
467 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  62.55 
 
 
475 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12940  (4Fe-4S) cluster-containing protein  63.27 
 
 
509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  61.9 
 
 
479 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  61.44 
 
 
498 aa  548  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2424  protein of unknown function DUF162  51.38 
 
 
479 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00298547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  43.45 
 
 
476 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  44.35 
 
 
473 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  43.53 
 
 
472 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  41.77 
 
 
480 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  40.79 
 
 
470 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  48.31 
 
 
480 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  41.05 
 
 
475 aa  359  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  40.59 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  40.59 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  40.59 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  43.64 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  46.8 
 
 
475 aa  355  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  46.21 
 
 
481 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  45.45 
 
 
489 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  42.37 
 
 
490 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  42.53 
 
 
470 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  43.08 
 
 
457 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  45.73 
 
 
481 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  42.95 
 
 
463 aa  351  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  41.2 
 
 
484 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  46.1 
 
 
481 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.79 
 
 
464 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  43.3 
 
 
458 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 
477 aa  347  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  40.6 
 
 
486 aa  346  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  45.55 
 
 
482 aa  345  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  39.78 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  39.57 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  39.57 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  39.57 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  39.57 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  39.57 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  39.38 
 
 
473 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  39.57 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  41.06 
 
 
473 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  39.57 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  39.57 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  39.79 
 
 
475 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  39.35 
 
 
473 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  38.46 
 
 
475 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 
475 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 
475 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  40.64 
 
 
476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  38.46 
 
 
475 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 
475 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  39.35 
 
 
473 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  39.37 
 
 
473 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.59 
 
 
484 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  42.51 
 
 
482 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  48.41 
 
 
475 aa  343  7e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  40.8 
 
 
478 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  42.46 
 
 
476 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 
475 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 
475 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  47.19 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
477 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
477 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  42.74 
 
 
482 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  38.12 
 
 
470 aa  340  4e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 
475 aa  340  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 
475 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  42.41 
 
 
477 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  40.8 
 
 
492 aa  339  7e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 
479 aa  339  7e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  42.41 
 
 
477 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  42.63 
 
 
458 aa  339  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  46.23 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  46.49 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  41.89 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  39.53 
 
 
474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  41.24 
 
 
472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  46.21 
 
 
481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  44.06 
 
 
471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>