243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0080 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 
475 aa  966    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  54.21 
 
 
481 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  48.09 
 
 
473 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  47.23 
 
 
470 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  45.28 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  45.28 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  47.76 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  45.06 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  45.06 
 
 
470 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  42.55 
 
 
473 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  42.37 
 
 
475 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  42.37 
 
 
475 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  42.15 
 
 
475 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  42.15 
 
 
475 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  42.15 
 
 
475 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  42.37 
 
 
475 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  42.37 
 
 
475 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  42.15 
 
 
475 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  41.94 
 
 
475 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  41.94 
 
 
473 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  43.52 
 
 
474 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  42.92 
 
 
489 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  40.55 
 
 
475 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  41.19 
 
 
473 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  43.46 
 
 
469 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  41.4 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  43.4 
 
 
469 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  43.04 
 
 
469 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  41.06 
 
 
473 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  42.43 
 
 
475 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.86 
 
 
470 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  42.86 
 
 
470 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  40.59 
 
 
470 aa  364  2e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  41.65 
 
 
476 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  42.19 
 
 
476 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  41.68 
 
 
471 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  42.77 
 
 
475 aa  358  9e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  42.92 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  41.26 
 
 
471 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  41.54 
 
 
477 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  42.12 
 
 
481 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  40.93 
 
 
484 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  40.35 
 
 
480 aa  351  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  43.22 
 
 
522 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  40.13 
 
 
470 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.16 
 
 
470 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  42.16 
 
 
470 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.96 
 
 
475 aa  348  8e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  40.47 
 
 
479 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.95 
 
 
470 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  43.2 
 
 
475 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  41.04 
 
 
481 aa  347  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 
472 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  43.44 
 
 
480 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  40.22 
 
 
464 aa  347  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  41.95 
 
 
470 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  41.31 
 
 
475 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  41.07 
 
 
480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  40.13 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.95 
 
 
470 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.95 
 
 
470 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  41.91 
 
 
483 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.91 
 
 
483 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.91 
 
 
483 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  41.91 
 
 
483 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  42.03 
 
 
472 aa  343  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.91 
 
 
536 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  41.53 
 
 
470 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  41.91 
 
 
483 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  41.7 
 
 
483 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  42.39 
 
 
463 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  40.51 
 
 
480 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  40.98 
 
 
477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  40.98 
 
 
477 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  40.76 
 
 
482 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  40.98 
 
 
482 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  39.2 
 
 
478 aa  338  9e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  41.11 
 
 
477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  38.65 
 
 
456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  41.11 
 
 
477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.07 
 
 
480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  41.59 
 
 
492 aa  336  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  41.05 
 
 
510 aa  336  7e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  40.51 
 
 
482 aa  336  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  41.95 
 
 
484 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  41.95 
 
 
484 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  41.95 
 
 
484 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  40.39 
 
 
481 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  38.19 
 
 
463 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  39.41 
 
 
490 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 
481 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  40.13 
 
 
481 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>