More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1314 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  48.54 
 
 
710 aa  658    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  51.12 
 
 
708 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
711 aa  1461    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  96.34 
 
 
711 aa  1422    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  53.59 
 
 
730 aa  764    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  79.3 
 
 
711 aa  1199    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  56.98 
 
 
714 aa  806    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  75.67 
 
 
712 aa  1148    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  56.24 
 
 
717 aa  781    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  44.48 
 
 
717 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  44.97 
 
 
721 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  41.63 
 
 
717 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  45.03 
 
 
716 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  44.54 
 
 
716 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  43.14 
 
 
712 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  42.36 
 
 
713 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  40.23 
 
 
767 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.04 
 
 
722 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  42.7 
 
 
470 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 
473 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  42.33 
 
 
470 aa  360  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  42.12 
 
 
489 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  38.51 
 
 
470 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  38.29 
 
 
470 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  38.29 
 
 
470 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  38.07 
 
 
470 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  39.56 
 
 
472 aa  330  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  36.01 
 
 
480 aa  326  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  39.18 
 
 
481 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.66 
 
 
480 aa  323  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.87 
 
 
470 aa  323  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  35.43 
 
 
470 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  36.5 
 
 
469 aa  319  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  36.44 
 
 
469 aa  317  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  36.07 
 
 
469 aa  317  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  35.73 
 
 
470 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  31.81 
 
 
741 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  36.07 
 
 
475 aa  310  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  36.09 
 
 
471 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  38.53 
 
 
479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  42.08 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  32.08 
 
 
741 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  35.65 
 
 
471 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  34.64 
 
 
470 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  34.42 
 
 
470 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  34.42 
 
 
470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 
479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.42 
 
 
470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  38.91 
 
 
471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.42 
 
 
470 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.42 
 
 
470 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.06 
 
 
470 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  35.99 
 
 
522 aa  300  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  36.47 
 
 
458 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  40.53 
 
 
463 aa  297  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  39.04 
 
 
469 aa  297  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  37.73 
 
 
463 aa  297  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  35.81 
 
 
476 aa  297  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  37.97 
 
 
496 aa  296  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  38.42 
 
 
481 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  37.74 
 
 
481 aa  295  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.56 
 
 
475 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 
481 aa  294  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  39.22 
 
 
490 aa  294  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  38.32 
 
 
481 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  38.58 
 
 
481 aa  293  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  34.62 
 
 
483 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  37.28 
 
 
475 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  38.43 
 
 
486 aa  293  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.62 
 
 
483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  34.62 
 
 
483 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.62 
 
 
483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.62 
 
 
536 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.62 
 
 
483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  36.19 
 
 
528 aa  291  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  34.62 
 
 
483 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  39.22 
 
 
477 aa  291  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  37.8 
 
 
481 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  38.16 
 
 
478 aa  291  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  38.48 
 
 
465 aa  291  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  34.99 
 
 
482 aa  291  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  40.1 
 
 
472 aa  291  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  36.29 
 
 
498 aa  291  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  37.56 
 
 
479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  38.01 
 
 
456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  36.19 
 
 
493 aa  290  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  36.98 
 
 
467 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  36.19 
 
 
493 aa  290  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  36.9 
 
 
475 aa  289  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  37.44 
 
 
486 aa  289  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
475 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  36.24 
 
 
476 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  36.59 
 
 
464 aa  288  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  35.65 
 
 
470 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  36.19 
 
 
494 aa  287  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  41.69 
 
 
480 aa  287  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  29.47 
 
 
812 aa  287  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  36.15 
 
 
473 aa  287  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 
480 aa  287  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.49 
 
 
545 aa  286  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>