More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0433 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  100 
 
 
722 aa  1491    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  34.85 
 
 
730 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  34.17 
 
 
717 aa  399  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  32.96 
 
 
711 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  34.99 
 
 
710 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  33.38 
 
 
717 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  34.04 
 
 
711 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  33.61 
 
 
708 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  33 
 
 
717 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  33.47 
 
 
714 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
711 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  33.93 
 
 
721 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  33.05 
 
 
716 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  33.52 
 
 
767 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  31.69 
 
 
716 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  31.64 
 
 
712 aa  361  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  33.14 
 
 
712 aa  360  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  31.5 
 
 
713 aa  347  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  33.99 
 
 
423 aa  261  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  38.78 
 
 
426 aa  260  6e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  28.04 
 
 
741 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.41 
 
 
423 aa  250  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  34.84 
 
 
400 aa  249  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  32.77 
 
 
423 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1225  hypothetical protein  37.43 
 
 
379 aa  244  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.229478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  29.23 
 
 
727 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  36.34 
 
 
382 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  35.09 
 
 
481 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0485  hypothetical protein  37.17 
 
 
382 aa  233  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.964373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  34.4 
 
 
470 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  33.25 
 
 
421 aa  232  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  31.81 
 
 
476 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  27.02 
 
 
738 aa  231  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0277  hypothetical protein  35.92 
 
 
391 aa  230  6e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  33.01 
 
 
421 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.55 
 
 
434 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  33.09 
 
 
421 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.12 
 
 
429 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  34.19 
 
 
473 aa  228  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1348  hypothetical protein  35.64 
 
 
386 aa  228  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  31.69 
 
 
475 aa  227  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  33.71 
 
 
470 aa  227  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  30.68 
 
 
446 aa  227  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1342  hypothetical protein  38.69 
 
 
380 aa  226  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.081676  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  29.88 
 
 
423 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.93 
 
 
414 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  33.83 
 
 
482 aa  222  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  34.04 
 
 
470 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.79 
 
 
426 aa  221  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.56 
 
 
426 aa  221  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  34.61 
 
 
458 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  33.57 
 
 
431 aa  220  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  31.52 
 
 
478 aa  220  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.28 
 
 
428 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  33.57 
 
 
470 aa  219  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  33.57 
 
 
470 aa  219  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  33.57 
 
 
470 aa  219  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  27.23 
 
 
741 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  34.29 
 
 
463 aa  218  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  35.84 
 
 
484 aa  218  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  32.61 
 
 
472 aa  218  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  35.36 
 
 
342 aa  218  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1037  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.05 
 
 
432 aa  217  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.106795  normal  0.550231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  34.09 
 
 
489 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  34.47 
 
 
463 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  31.57 
 
 
428 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  36.29 
 
 
375 aa  217  7e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  36.44 
 
 
475 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.05 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  34.53 
 
 
383 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  29.98 
 
 
470 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  34.77 
 
 
464 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1863  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.78 
 
 
430 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  35.37 
 
 
480 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  34.35 
 
 
472 aa  213  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  31.76 
 
 
470 aa  213  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  32.78 
 
 
469 aa  213  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  35.71 
 
 
475 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  25.61 
 
 
812 aa  211  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.92 
 
 
480 aa  210  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.51 
 
 
414 aa  210  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  35.67 
 
 
481 aa  210  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  31.49 
 
 
469 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  30.41 
 
 
471 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  31.45 
 
 
475 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  31.45 
 
 
475 aa  209  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  36.55 
 
 
481 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  31.45 
 
 
475 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  31.45 
 
 
475 aa  209  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  31.72 
 
 
479 aa  209  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  29.36 
 
 
471 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  31.24 
 
 
473 aa  208  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  31.78 
 
 
469 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  31.24 
 
 
475 aa  207  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  31.39 
 
 
482 aa  207  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  31.39 
 
 
477 aa  207  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  31.24 
 
 
475 aa  207  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  31.39 
 
 
477 aa  207  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  31.81 
 
 
477 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  31.81 
 
 
482 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>