More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0607 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0607  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  892    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.682532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0385  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  67.86 
 
 
420 aa  600  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1616  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  59.72 
 
 
426 aa  530  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1568  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  58.95 
 
 
420 aa  525  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000718376  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1071  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  54.89 
 
 
421 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1009  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  54.65 
 
 
421 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0798  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  54.65 
 
 
421 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1132  conserved hypothetical protein, putative iron-sulfur-cluster binding protein  54.74 
 
 
422 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  30.47 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  31.16 
 
 
421 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  29.88 
 
 
421 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  30.12 
 
 
428 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.45 
 
 
426 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.22 
 
 
426 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  29.26 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  31.04 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  31.25 
 
 
423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  29.98 
 
 
423 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1037  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.73 
 
 
432 aa  195  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.106795  normal  0.550231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.12 
 
 
414 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.43 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.43 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.41 
 
 
423 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.76 
 
 
438 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.47 
 
 
414 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  27.01 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1863  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.69 
 
 
430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  28.44 
 
 
428 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0393  hypothetical protein  28.35 
 
 
437 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.544976  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  26.9 
 
 
711 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3240  iron-sulfur cluster-binding protein  28.12 
 
 
430 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.730489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.07 
 
 
722 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.73 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.51 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.78 
 
 
433 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  27.27 
 
 
445 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1993  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.52 
 
 
431 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.18 
 
 
411 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  27.01 
 
 
453 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  26.81 
 
 
441 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  28.3 
 
 
712 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0345  hypothetical protein  27.29 
 
 
431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268241  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  26.93 
 
 
711 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.89 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  26.9 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  26.89 
 
 
711 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.19 
 
 
447 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  27.27 
 
 
717 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.9 
 
 
442 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.42 
 
 
447 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.74 
 
 
708 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  25.71 
 
 
458 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.27 
 
 
543 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  25.67 
 
 
413 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.85 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  29.15 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  28.08 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  29.06 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25.89 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  26.81 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  29.3 
 
 
442 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  27.88 
 
 
714 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  29.3 
 
 
442 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  29.3 
 
 
442 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.6 
 
 
447 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  27.32 
 
 
472 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  25.42 
 
 
450 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.39 
 
 
442 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  28.39 
 
 
442 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.39 
 
 
442 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.39 
 
 
442 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.41 
 
 
442 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  27.18 
 
 
416 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.3 
 
 
413 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  25.72 
 
 
430 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.88 
 
 
445 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.69 
 
 
442 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  25.8 
 
 
507 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  26.62 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.56 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.76 
 
 
430 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.05 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  28.97 
 
 
442 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.02 
 
 
452 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.49 
 
 
420 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  25.47 
 
 
730 aa  136  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  24.94 
 
 
767 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.61 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0717  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  32.18 
 
 
538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.942612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  25.17 
 
 
435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  25.49 
 
 
412 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  24.71 
 
 
426 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.53 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  25.35 
 
 
435 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.06 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  25.58 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  26.87 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0085  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  27.66 
 
 
489 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52676  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.91 
 
 
481 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>