More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3039 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.24 
 
 
662 aa  877    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  64.75 
 
 
671 aa  928    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  62.99 
 
 
663 aa  870    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  64.95 
 
 
661 aa  927    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  67.27 
 
 
661 aa  926    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  79.55 
 
 
714 aa  1093    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  100 
 
 
661 aa  1366    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  71.26 
 
 
661 aa  998    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  67.27 
 
 
661 aa  940    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  60.39 
 
 
662 aa  846    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  78.64 
 
 
722 aa  1082    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.24 
 
 
662 aa  875    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.34 
 
 
699 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.24 
 
 
694 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.9 
 
 
694 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.27 
 
 
686 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  35.72 
 
 
727 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  34.69 
 
 
752 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  36.14 
 
 
730 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  37.93 
 
 
678 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.85 
 
 
713 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  37.88 
 
 
714 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.27 
 
 
683 aa  436  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  35.82 
 
 
658 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  35.86 
 
 
659 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  35.82 
 
 
661 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.84 
 
 
663 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  36.6 
 
 
655 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  35.12 
 
 
661 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  35.36 
 
 
652 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.69 
 
 
656 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.69 
 
 
656 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.61 
 
 
658 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.61 
 
 
663 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.56 
 
 
664 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  32.62 
 
 
703 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  32.34 
 
 
703 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  32.48 
 
 
703 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  32.48 
 
 
703 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  32.48 
 
 
703 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  32.34 
 
 
703 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  32.62 
 
 
703 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.94 
 
 
655 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  32.34 
 
 
703 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  31.99 
 
 
703 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35 
 
 
658 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.08 
 
 
698 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  32.34 
 
 
703 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.26 
 
 
699 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.52 
 
 
664 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  33.53 
 
 
678 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  32.84 
 
 
711 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.99 
 
 
711 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.62 
 
 
743 aa  365  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.38 
 
 
679 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  34.7 
 
 
720 aa  364  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  33.53 
 
 
720 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.65 
 
 
711 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.53 
 
 
676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  34.04 
 
 
683 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.32 
 
 
989 aa  357  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  32.33 
 
 
629 aa  357  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  32.37 
 
 
732 aa  357  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.55 
 
 
723 aa  355  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  31.68 
 
 
716 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  35.65 
 
 
654 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  32.89 
 
 
718 aa  350  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3824  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.31 
 
 
728 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.676113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  31.76 
 
 
716 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.69 
 
 
722 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  31.84 
 
 
699 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  34.32 
 
 
692 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  31.89 
 
 
727 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1707  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.99 
 
 
737 aa  332  9e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.91 
 
 
721 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  30.52 
 
 
882 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0042  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.86 
 
 
738 aa  323  5e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.29 
 
 
717 aa  323  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  31.92 
 
 
683 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.6 
 
 
748 aa  321  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.79 
 
 
762 aa  320  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  31.45 
 
 
688 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 
724 aa  320  5e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  29.06 
 
 
1033 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.4 
 
 
737 aa  317  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0933  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.73 
 
 
695 aa  313  5.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271519  normal  0.676616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  29.23 
 
 
1388 aa  313  5.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.77 
 
 
737 aa  310  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  32.44 
 
 
703 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  30.98 
 
 
762 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.7 
 
 
758 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.71 
 
 
774 aa  301  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.97 
 
 
641 aa  300  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  30.38 
 
 
643 aa  290  7e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  29.86 
 
 
1027 aa  290  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  32.28 
 
 
639 aa  289  1e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.34 
 
 
1131 aa  284  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  42.14 
 
 
739 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.12 
 
 
712 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  36.83 
 
 
654 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>