More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2756 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  80.77 
 
 
420 aa  663    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  854    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  64.85 
 
 
425 aa  571  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.64 
 
 
543 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.48 
 
 
474 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  49.88 
 
 
428 aa  360  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  49.14 
 
 
426 aa  358  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  50.49 
 
 
416 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  46.62 
 
 
433 aa  352  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  46.45 
 
 
435 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.7 
 
 
447 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.06 
 
 
445 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  45.41 
 
 
433 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  47.46 
 
 
430 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  48.67 
 
 
412 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  44.99 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.41 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.69 
 
 
447 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  45.31 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.52 
 
 
465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.71 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.45 
 
 
447 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  43.1 
 
 
450 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  44.06 
 
 
465 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.39 
 
 
447 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  45.37 
 
 
447 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.06 
 
 
465 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.36 
 
 
453 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  42.59 
 
 
431 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.63 
 
 
471 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.63 
 
 
431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.29 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.74 
 
 
436 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  43.71 
 
 
435 aa  325  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  42.57 
 
 
434 aa  322  7e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  42.05 
 
 
446 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  42.51 
 
 
437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.17 
 
 
442 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.85 
 
 
438 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.72 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.83 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  45.59 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.55 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.74 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  44.06 
 
 
458 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  45.11 
 
 
445 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  44.58 
 
 
439 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  44.07 
 
 
435 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.07 
 
 
437 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.25 
 
 
436 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  43.78 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.37 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  43.24 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  40.77 
 
 
441 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.25 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  44.99 
 
 
472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  43.46 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.14 
 
 
432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.03 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  43.75 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.83 
 
 
438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  42.76 
 
 
507 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.2 
 
 
437 aa  303  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.78 
 
 
465 aa  302  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.61 
 
 
445 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  44.12 
 
 
453 aa  297  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.96 
 
 
453 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.28 
 
 
452 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  44.58 
 
 
438 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  43.35 
 
 
445 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  42.11 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.01 
 
 
417 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.03 
 
 
423 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.19 
 
 
402 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.74 
 
 
407 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.49 
 
 
407 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.49 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.49 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  40.49 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.49 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.49 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.6 
 
 
406 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  39.8 
 
 
416 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.34 
 
 
405 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.76 
 
 
414 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.14 
 
 
410 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.22 
 
 
408 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.63 
 
 
418 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.6 
 
 
406 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.22 
 
 
408 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.22 
 
 
408 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.8 
 
 
408 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.98 
 
 
408 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.98 
 
 
408 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.98 
 
 
408 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.98 
 
 
408 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.23 
 
 
415 aa  263  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.22 
 
 
426 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.19 
 
 
402 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.71 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0911371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>