More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1761 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  81.98 
 
 		 446 aa  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  80.17 
 
 		 465 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  90.6 
 
 		 447 aa  819    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  80.17 
 
 		 465 aa  728    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  81.33 
 
 		 465 aa  751    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  902    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  64.22 
 
 		 435 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  63.68 
 
 		 439 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  64.75 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  65.98 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  65.53 
 
 		 443 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.45 
 
 		 436 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  65.13 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  62.81 
 
 		 446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  62.7 
 
 		 437 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.81 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.24 
 
 		 437 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.92 
 
 		 436 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  62.99 
 
 		 437 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  62.16 
 
 		 437 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  62.93 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  62.08 
 
 		 439 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  64.52 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.9 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.06 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.61 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  62.21 
 
 		 434 aa  542  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  63.82 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  62.93 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  62.79 
 
 		 441 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  63.22 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  60.37 
 
 		 436 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.58 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.9 
 
 		 406 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  47.16 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.52 
 
 		 405 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.26 
 
 		 413 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  46.88 
 
 		 410 aa  340  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.94 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.55 
 
 		 409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.53 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.45 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.69 
 
 		 407 aa  335  7e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.45 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.45 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  42.45 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.45 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.45 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.17 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44 
 
 		 411 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.51 
 
 		 411 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.52 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.08 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.03 
 
 		 410 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.26 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.66 
 
 		 410 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.77 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.56 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.55 
 
 		 403 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.04 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.44 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.22 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.22 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.22 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  45.41 
 
 		 425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.22 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.22 
 
 		 408 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  44.5 
 
 		 428 aa  328  8e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.22 
 
 		 408 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.97 
 
 		 449 aa  328  9e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.52 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.93 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.99 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.82 
 
 		 543 aa  325  9e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.42 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39.25 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.22 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.12 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.3 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.5 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.61 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  45.12 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.42 
 
 		 411 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.48 
 
 		 447 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  42.62 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.59 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.89 
 
 		 404 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.82 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.55 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.46 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.26 
 
 		 447 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.33 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  38.68 
 
 		 450 aa  319  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.43 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.82 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.6 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.82 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.36 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.82 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  41.37 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>