More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2540 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
432 aa  879    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  65.97 
 
 
435 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.29 
 
 
465 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  64.8 
 
 
433 aa  570  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  66.36 
 
 
430 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.59 
 
 
436 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  66.21 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  65.82 
 
 
439 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  66.43 
 
 
443 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  63.17 
 
 
465 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  63.17 
 
 
465 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  64.9 
 
 
447 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.36 
 
 
436 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.19 
 
 
431 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.43 
 
 
447 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  60.55 
 
 
437 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  61.36 
 
 
437 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  62.87 
 
 
438 aa  541  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.79 
 
 
437 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  62.07 
 
 
437 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.36 
 
 
437 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  61.87 
 
 
441 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  60.56 
 
 
445 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  57.44 
 
 
446 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  58.1 
 
 
439 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  57.47 
 
 
434 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.99 
 
 
433 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  60.69 
 
 
431 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  58.53 
 
 
433 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  58.53 
 
 
433 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  57.74 
 
 
431 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  58.99 
 
 
436 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.1 
 
 
437 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  49.53 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  46.7 
 
 
402 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.03 
 
 
413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.5 
 
 
402 aa  343  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.71 
 
 
406 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  44.55 
 
 
416 aa  342  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.5 
 
 
403 aa  342  9e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.68 
 
 
405 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.44 
 
 
412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.86 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.56 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.31 
 
 
416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.81 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.34 
 
 
408 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.34 
 
 
408 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.34 
 
 
408 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.34 
 
 
408 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.23 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.34 
 
 
408 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.34 
 
 
408 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.12 
 
 
413 aa  338  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.31 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.42 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.29 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.44 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.26 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.36 
 
 
411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.77 
 
 
449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.1 
 
 
408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.04 
 
 
402 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.59 
 
 
407 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.55 
 
 
415 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.59 
 
 
407 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.39 
 
 
411 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.59 
 
 
407 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.59 
 
 
407 aa  333  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.59 
 
 
407 aa  333  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  43.59 
 
 
407 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.59 
 
 
407 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.22 
 
 
416 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.72 
 
 
411 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.06 
 
 
415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.15 
 
 
410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.12 
 
 
410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.36 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.04 
 
 
405 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.76 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.21 
 
 
418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.62 
 
 
411 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.78 
 
 
409 aa  325  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1894  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.63 
 
 
421 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  46.24 
 
 
425 aa  325  7e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.65 
 
 
414 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.53 
 
 
408 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.12 
 
 
408 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.62 
 
 
412 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.79 
 
 
405 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.32 
 
 
411 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.3 
 
 
408 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.58 
 
 
404 aa  322  7e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.5 
 
 
422 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.96 
 
 
408 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.96 
 
 
408 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.96 
 
 
408 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.3 
 
 
423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.29 
 
 
418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.03 
 
 
408 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>