More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0189 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  100 
 
 
453 aa  919    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  79.73 
 
 
458 aa  732    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  67.1 
 
 
507 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.16 
 
 
445 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  50.94 
 
 
433 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  49.88 
 
 
471 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  46.85 
 
 
450 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.19 
 
 
447 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.74 
 
 
447 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.67 
 
 
453 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  49.04 
 
 
449 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  47.64 
 
 
474 aa  362  6e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.43 
 
 
447 aa  352  7e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.33 
 
 
430 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  48.3 
 
 
412 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.29 
 
 
543 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.6 
 
 
445 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.04 
 
 
438 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.41 
 
 
438 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  44.63 
 
 
428 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  46.7 
 
 
416 aa  319  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  46.28 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.34 
 
 
440 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  43.34 
 
 
472 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  43.88 
 
 
426 aa  289  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  43.41 
 
 
425 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.95 
 
 
465 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  39.13 
 
 
435 aa  279  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  41.47 
 
 
435 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.93 
 
 
420 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.43 
 
 
425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  39.47 
 
 
433 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.47 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  37.92 
 
 
433 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  39.26 
 
 
445 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  37.22 
 
 
416 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  40.1 
 
 
433 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  39.9 
 
 
435 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  38.52 
 
 
441 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.24 
 
 
447 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.43 
 
 
436 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  38.41 
 
 
431 aa  256  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  37.92 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.86 
 
 
436 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  36.14 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.78 
 
 
465 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.47 
 
 
442 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.43 
 
 
413 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  36.19 
 
 
413 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.93 
 
 
431 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.73 
 
 
433 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.5 
 
 
463 aa  249  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.17 
 
 
413 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  36.82 
 
 
446 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  37.83 
 
 
447 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.42 
 
 
453 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.94 
 
 
438 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  38.8 
 
 
431 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  36.92 
 
 
441 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  36.63 
 
 
439 aa  243  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.79 
 
 
437 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.17 
 
 
437 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.63 
 
 
452 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  37.79 
 
 
443 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.32 
 
 
465 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  36.32 
 
 
465 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  33.57 
 
 
446 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.44 
 
 
432 aa  239  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.95 
 
 
437 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  35.25 
 
 
437 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.41 
 
 
439 aa  236  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.08 
 
 
437 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.3 
 
 
437 aa  232  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.77 
 
 
442 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  32.37 
 
 
442 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  31.28 
 
 
442 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  31.53 
 
 
442 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.28 
 
 
442 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.28 
 
 
442 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.28 
 
 
442 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.02 
 
 
442 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.52 
 
 
402 aa  223  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  37.74 
 
 
436 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  36.38 
 
 
445 aa  220  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  31.03 
 
 
442 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  31.03 
 
 
442 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.03 
 
 
442 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  35.63 
 
 
432 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  33.18 
 
 
460 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.41 
 
 
419 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.2 
 
 
413 aa  199  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.85 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.51 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  31.63 
 
 
431 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.04 
 
 
408 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.04 
 
 
408 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.04 
 
 
408 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.04 
 
 
408 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.04 
 
 
408 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.04 
 
 
408 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>