More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2304 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.49 
 
 		 407 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  76.49 
 
 		 407 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.24 
 
 		 407 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  80.94 
 
 		 411 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.21 
 
 		 423 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  76.49 
 
 		 407 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  75.25 
 
 		 410 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  84.65 
 
 		 405 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  81.44 
 
 		 410 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.49 
 
 		 407 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.24 
 
 		 407 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  100 
 
 		 405 aa  822    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  83.17 
 
 		 411 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  81.68 
 
 		 411 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  82.18 
 
 		 411 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  84.9 
 
 		 405 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.49 
 
 		 407 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  73.79 
 
 		 413 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  74.81 
 
 		 406 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  74.57 
 
 		 406 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  73.28 
 
 		 409 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  74.32 
 
 		 406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  67.73 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  72.77 
 
 		 408 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  72.28 
 
 		 408 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.04 
 
 		 449 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.85 
 
 		 418 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.32 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.41 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.85 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.45 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.7 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.2 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.19 
 
 		 408 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.13 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.83 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.46 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.51 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.7 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.21 
 
 		 403 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.71 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.45 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.78 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.49 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.45 
 
 		 408 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.97 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.63 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.47 
 
 		 410 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.63 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.63 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.21 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.21 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.21 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.21 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.09 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.86 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.62 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.21 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.21 
 
 		 408 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.97 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.21 
 
 		 408 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.25 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.51 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3640  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.38 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.31 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.97 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.55 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.07 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.76 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.7 
 
 		 418 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.47 
 
 		 411 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.93 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  54.55 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.55 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.04 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7456  hypothetical protein  77.96 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0412051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1894  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.64 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1500  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  50.92 
 
 		 409 aa  391  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.899863 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  44.89 
 
 		 435 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  44.39 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.63 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  44.42 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.16 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  44.15 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.34 
 
 		 447 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  44.08 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.12 
 
 		 465 aa  346  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.05 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  43.76 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.3 
 
 		 431 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.81 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.22 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.16 
 
 		 437 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  45.45 
 
 		 431 aa  339  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  45.52 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  43.87 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.08 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.34 
 
 		 465 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  42.34 
 
 		 465 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.668833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>