More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0125 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.27 
 
 		 412 aa  670    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.03 
 
 		 412 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  74.82 
 
 		 419 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  100 
 
 		 415 aa  855    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.47 
 
 		 410 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  75.3 
 
 		 422 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  81.01 
 
 		 410 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  75.36 
 
 		 416 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  73.14 
 
 		 412 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3640  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  74.22 
 
 		 413 aa  617  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.79 
 
 		 424 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  68.74 
 
 		 418 aa  581  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.39 
 
 		 418 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.57 
 
 		 414 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.72 
 
 		 423 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.86 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.42 
 
 		 411 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.95 
 
 		 417 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.2 
 
 		 408 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.95 
 
 		 408 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.23 
 
 		 408 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.26 
 
 		 408 aa  524  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.26 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.02 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.99 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.74 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.99 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.99 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.99 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.02 
 
 		 408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.02 
 
 		 408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.77 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.77 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.77 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.77 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.02 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.84 
 
 		 413 aa  504  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.07 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.77 
 
 		 411 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.17 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.59 
 
 		 410 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.13 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.07 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.09 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.22 
 
 		 411 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.74 
 
 		 419 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.45 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.4 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.46 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.66 
 
 		 407 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.83 
 
 		 411 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.07 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.66 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.66 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.66 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.77 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.66 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.5 
 
 		 405 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.42 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.34 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  55.66 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.25 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.64 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.83 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.59 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.1 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.59 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.41 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.66 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.63 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.7 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1500  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.01 
 
 		 409 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.899863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.45 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.52 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.76 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.12 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  49.64 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1894  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.99 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.99 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  43.28 
 
 		 446 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.98 
 
 		 465 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  42.73 
 
 		 435 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  42.23 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  42.56 
 
 		 430 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  42.17 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.01 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.6 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  41.97 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.61 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.09 
 
 		 432 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  41.67 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.09 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.84 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  40.84 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  43.28 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  42.17 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.12 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.24 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  42.82 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.05 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>