More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0186 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.21 
 
 		 412 aa  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  99.03 
 
 		 412 aa  834    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  100 
 
 		 412 aa  841    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.27 
 
 		 415 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  83.17 
 
 		 416 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  73.68 
 
 		 422 aa  646    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.48 
 
 		 410 aa  664    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.51 
 
 		 410 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  81.16 
 
 		 419 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3640  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  74.28 
 
 		 413 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.72 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.52 
 
 		 418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.49 
 
 		 411 aa  542  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.29 
 
 		 423 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  65.53 
 
 		 408 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.27 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.83 
 
 		 408 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.11 
 
 		 408 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.25 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.41 
 
 		 418 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.01 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.37 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.86 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.58 
 
 		 414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.37 
 
 		 408 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.37 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.13 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.13 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.13 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.13 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.62 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.17 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.62 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.86 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.38 
 
 		 408 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.86 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.86 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.05 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.38 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.17 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.2 
 
 		 410 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.86 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.08 
 
 		 405 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.87 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.87 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  57.87 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.63 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.97 
 
 		 410 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.87 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.6 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.87 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.87 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.29 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.19 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.11 
 
 		 411 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.73 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.07 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.63 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.28 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.04 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.9 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.93 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.26 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.68 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.63 
 
 		 413 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.17 
 
 		 406 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.17 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.61 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1500  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.84 
 
 		 409 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.899863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.21 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.96 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.74 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.56 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.75 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  51.32 
 
 		 416 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1894  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.04 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  44.27 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.26 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.7 
 
 		 432 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  45.77 
 
 		 439 aa  335  7.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.5 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  44.76 
 
 		 431 aa  332  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.76 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  42.09 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  42.66 
 
 		 446 aa  329  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  43.65 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  42 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.45 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  43.22 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.71 
 
 		 465 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  42.73 
 
 		 446 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.49 
 
 		 436 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  43.45 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.4 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.87 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  44.13 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.82 
 
 		 436 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  44.24 
 
 		 436 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>