More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3258 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  100 
 
 		 424 aa  869    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3640  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.36 
 
 		 413 aa  658    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  70.14 
 
 		 418 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.79 
 
 		 415 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.72 
 
 		 412 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  68.56 
 
 		 410 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.48 
 
 		 412 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.54 
 
 		 410 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  67.14 
 
 		 422 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.01 
 
 		 419 aa  586  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  66.43 
 
 		 412 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.54 
 
 		 411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  67.84 
 
 		 416 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.59 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.73 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.36 
 
 		 418 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.31 
 
 		 408 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.76 
 
 		 408 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.31 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.76 
 
 		 408 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.14 
 
 		 408 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.38 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.53 
 
 		 408 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.53 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.53 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.53 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.23 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.53 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.93 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.17 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.47 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.47 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.47 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.09 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.94 
 
 		 408 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.09 
 
 		 408 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.92 
 
 		 426 aa  477  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.16 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.83 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.55 
 
 		 411 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.12 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.48 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.97 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.85 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.61 
 
 		 405 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.21 
 
 		 405 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.63 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.4 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.4 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.63 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.4 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.4 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.43 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  53.4 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.5 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.27 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.57 
 
 		 410 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.65 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52 
 
 		 409 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.63 
 
 		 411 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.25 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.18 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.46 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.37 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.13 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.54 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  51.42 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1500  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.69 
 
 		 409 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.899863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  51.98 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  51.18 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.01 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.84 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.12 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  51.89 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  50.6 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  49.76 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  50.47 
 
 		 408 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1894  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.5 
 
 		 421 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.53 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  42.27 
 
 		 431 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  41.97 
 
 		 430 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.87 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  40.78 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.92 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  41.8 
 
 		 431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  41.97 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  42.03 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  41.4 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.29 
 
 		 465 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  39.29 
 
 		 465 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  43.39 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.01 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.72 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  43.55 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  41.1 
 
 		 439 aa  312  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.11 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.13 
 
 		 447 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.4 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  40.64 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>