More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2516 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.56 
 
 		 408 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  100 
 
 		 408 aa  846    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.56 
 
 		 408 aa  698    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.8 
 
 		 408 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  82.27 
 
 		 408 aa  708    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  81.53 
 
 		 408 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  82.02 
 
 		 408 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  81.53 
 
 		 408 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  80.79 
 
 		 408 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  87.71 
 
 		 408 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  86 
 
 		 408 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  82.27 
 
 		 408 aa  708    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.56 
 
 		 408 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  81.53 
 
 		 408 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.8 
 
 		 408 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  82.27 
 
 		 408 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.8 
 
 		 408 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.56 
 
 		 408 aa  698    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  65.32 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  66.02 
 
 		 423 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.86 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  63.2 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  65.53 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.44 
 
 		 418 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  65.29 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.32 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  66.09 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3640  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  64.34 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.31 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.62 
 
 		 410 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.8 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.17 
 
 		 419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  62.65 
 
 		 416 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.24 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.52 
 
 		 426 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.86 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.27 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.5 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.27 
 
 		 405 aa  481  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.53 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.57 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.83 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.13 
 
 		 411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.72 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.5 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.37 
 
 		 411 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.61 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.86 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.72 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.09 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.61 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.72 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.63 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.11 
 
 		 411 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.62 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.81 
 
 		 410 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.63 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.66 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.59 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.83 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.6 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.9 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.32 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.32 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  53.32 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.32 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.32 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.32 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.32 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1500  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.76 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.899863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.71 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.66 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  51.2 
 
 		 419 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  53.66 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  51.71 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.32 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.09 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1894  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.99 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.66 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  45 
 
 		 439 aa  345  8e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  42.59 
 
 		 430 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.55 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  41.26 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  43.29 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  44.13 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.08 
 
 		 436 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.65 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  41.27 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  43.63 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  44.05 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  41.71 
 
 		 446 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  40.23 
 
 		 437 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.1 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  42.86 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.86 
 
 		 437 aa  322  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  43.57 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  41.81 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.5 
 
 		 465 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.93 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.72 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>