More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2894 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  72.71 
 
 		 433 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  72.94 
 
 		 433 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  900    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  81.11 
 
 		 446 aa  734    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  78.5 
 
 		 439 aa  710    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  75 
 
 		 431 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  71.73 
 
 		 433 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  62.73 
 
 		 439 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.44 
 
 		 447 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  62.21 
 
 		 447 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  60.97 
 
 		 430 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  58.61 
 
 		 465 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  58.45 
 
 		 435 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.25 
 
 		 431 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  58.53 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  59.04 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.26 
 
 		 436 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.04 
 
 		 465 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  60.87 
 
 		 443 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  58.88 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.26 
 
 		 436 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  57.93 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.42 
 
 		 437 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  58.39 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  56.06 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  55.56 
 
 		 437 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  54.82 
 
 		 437 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  55.02 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.61 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.47 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  57.31 
 
 		 441 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  55.07 
 
 		 431 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.65 
 
 		 437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.26 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.74 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.29 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.29 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.29 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.29 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.52 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.37 
 
 		 412 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.29 
 
 		 408 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.57 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.29 
 
 		 408 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.5 
 
 		 408 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.42 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.37 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.57 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.26 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.13 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.65 
 
 		 445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.26 
 
 		 408 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.26 
 
 		 408 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.26 
 
 		 408 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.59 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.33 
 
 		 423 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.86 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.57 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.15 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.37 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.62 
 
 		 408 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.63 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.13 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.13 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.13 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.13 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  41.13 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.13 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.3 
 
 		 417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.04 
 
 		 410 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.36 
 
 		 418 aa  318  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.59 
 
 		 543 aa  318  9e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.65 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.55 
 
 		 410 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.23 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.52 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.41 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.4 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.55 
 
 		 418 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.07 
 
 		 414 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.41 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.06 
 
 		 449 aa  315  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.98 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.9 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3640  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.02 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.93 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  41.83 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.71 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  38.44 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.43 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.19 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  40.99 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.95 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.59 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.52 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.19 
 
 		 411 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.9 
 
 		 405 aa  309  8e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.19 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.52 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>