More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1266 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 		 437 aa  879    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  54.42 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.27 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  52.69 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.95 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  52.8 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.22 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  52.04 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  51.05 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.23 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  47.61 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.68 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.8 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  50.12 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.56 
 
 		 465 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  49.56 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.23 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  48.97 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.11 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  49.55 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.11 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  50.11 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  47 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  52.97 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  49.65 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  49.43 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.85 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  49.43 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  48.18 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.51 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  48.06 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.1 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  47.1 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  48.47 
 
 		 410 aa  316  6e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.31 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.99 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.32 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.11 
 
 		 449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3640  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.06 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.13 
 
 		 423 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  43.93 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.37 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.37 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.37 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.37 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.02 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.82 
 
 		 412 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.02 
 
 		 408 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.12 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.02 
 
 		 408 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.31 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.42 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.9 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.78 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.84 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.23 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.07 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.78 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.86 
 
 		 425 aa  294  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.76 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.51 
 
 		 408 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.28 
 
 		 411 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.24 
 
 		 413 aa  292  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.86 
 
 		 412 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.27 
 
 		 408 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.66 
 
 		 408 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  41.13 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.09 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.23 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.71 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.8 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.33 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.09 
 
 		 408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.48 
 
 		 405 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.71 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.71 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.71 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.23 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.71 
 
 		 405 aa  289  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.42 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.09 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.38 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.51 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.34 
 
 		 406 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.91 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.22 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.81 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.15 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.78 
 
 		 419 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.24 
 
 		 410 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.91 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.91 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.91 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.91 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  37.91 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.38 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.39 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.63 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.64 
 
 		 403 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0156765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>