More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7456 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7456  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0412051  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  88.85 
 
 
423 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  79.44 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.39 
 
 
406 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.01 
 
 
406 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.96 
 
 
405 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.14 
 
 
405 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  76.73 
 
 
411 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  78.08 
 
 
406 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  77.14 
 
 
409 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  74.69 
 
 
411 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  75.51 
 
 
411 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  73.88 
 
 
411 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  71.43 
 
 
407 aa  358  6e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  71.43 
 
 
407 aa  358  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  71.43 
 
 
407 aa  358  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  71.43 
 
 
407 aa  358  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  71.43 
 
 
407 aa  358  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  71.43 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  71.02 
 
 
407 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.39 
 
 
410 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  71.02 
 
 
407 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  72.24 
 
 
405 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  69.39 
 
 
408 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.85 
 
 
419 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  61.76 
 
 
449 aa  308  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.51 
 
 
415 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.94 
 
 
415 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.51 
 
 
408 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.51 
 
 
408 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.83 
 
 
408 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.83 
 
 
408 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.51 
 
 
408 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.51 
 
 
408 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.83 
 
 
408 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.51 
 
 
408 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.51 
 
 
408 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.43 
 
 
408 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.63 
 
 
402 aa  296  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.48 
 
 
417 aa  295  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.48 
 
 
413 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.89 
 
 
403 aa  295  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.25 
 
 
418 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  59.11 
 
 
408 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.75 
 
 
414 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.3 
 
 
408 aa  294  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.03 
 
 
408 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  68.16 
 
 
408 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.22 
 
 
408 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.11 
 
 
402 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.52 
 
 
408 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.82 
 
 
408 aa  291  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.63 
 
 
408 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.73 
 
 
408 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  60.08 
 
 
419 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.35 
 
 
423 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.68 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.06 
 
 
412 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.47 
 
 
412 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.33 
 
 
426 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.77 
 
 
410 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.09 
 
 
402 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.54 
 
 
411 aa  279  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.54 
 
 
412 aa  278  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  58.3 
 
 
410 aa  278  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3640  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.67 
 
 
413 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0773057  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  55.56 
 
 
422 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.26 
 
 
411 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  57.49 
 
 
402 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.45 
 
 
416 aa  271  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.9 
 
 
410 aa  271  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  56.15 
 
 
424 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  54.39 
 
 
418 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.72 
 
 
416 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  54.72 
 
 
416 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  53.78 
 
 
401 aa  248  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  52.63 
 
 
404 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1500  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  50.93 
 
 
409 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.899863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1894  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.43 
 
 
421 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.23 
 
 
437 aa  214  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  46.01 
 
 
443 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  44.57 
 
 
435 aa  211  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.04 
 
 
436 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.66 
 
 
436 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.22 
 
 
437 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.85 
 
 
438 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  43.75 
 
 
437 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  43.89 
 
 
433 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.74 
 
 
437 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  43.54 
 
 
446 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  46.96 
 
 
431 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.45 
 
 
432 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.66 
 
 
465 aa  198  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  42.03 
 
 
441 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  42.75 
 
 
439 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.12 
 
 
437 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  45.45 
 
 
431 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  43.4 
 
 
430 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  43.02 
 
 
436 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.73 
 
 
439 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>